BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus (Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains). In Lukáš Vacek. XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017. 1st ed. Brno: Masarykova Univerzita, 2017, p. 50. ISBN 978-80-210-8585-5.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus
Name in Czech Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus
Name (in English) Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains
Authors BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ.
Edition 1. vyd. Brno, XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017, p. 50-50, 2017.
Publisher Masarykova Univerzita
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Publication form printed version "print"
WWW XXVI. Tomáškovy dny mladých mikrobiologů
Organization unit Faculty of Science
ISBN 978-80-210-8585-5
Keywords (in Czech) ETB plazmid, exfoliativní toxin B, fylogeneze, genomová analýza
Keywords in English ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis
Tags NZ
Changed by Changed by: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Changed: 19/4/2018 14:45.
Abstract
Schopnost některých kmenů S. aureus produkovat exfoliativní toxiny je podmíněna obsahem specifických mobilních genetických elementů. Z hlediska medicínské praxe jsou nejvýznamnější exfoliativní toxiny A a B, které jsou kódovány geny lokalizovanými na profágu, respektive plazmidu. V této práci byly charakterizovány plazmidy kódující exfoliativní toxin B (ETB plazmidy), které byly izolovány z klinických kmenů zodpovědných za hromadná epidermolytická onemocnění v českých porodnicích. Byla provedena genotypizace a restrikční analýza plazmidů i jejich hostitelských kmenů. Na základě sekvenční analýzy byla navržena multiplex PCR pro detekci všech sekvenčních typů ETB plazmidů. Sekvenování, multiplex PCR a komparativní analýza ukázaly, že většina ETB plazmidů sdílí společnou „core“ sekvenci, typickou přítomností genů pro bakteriociny, inhibitor epidermální diferenciace typu C či rezistenci ke kadmiu. Tvoří tak ucelenou linii (I), jejíž zástupce lze rozdělit do čtyř sekvenčních typů podle přítomnosti specifických genomových úseků. Ty jsou tvořeny replikačními geny či transpozony kódujícími rezistenci k antibiotikům. Všechny plazmidy této linie byly detekovány v kmenech klonálního komplexu CC121, které často obsahovaly i profága s genem pro exfoliativní toxin A. Z bezprofágového kmene sekvenčního typu ST130 byl izolován dosud nepopsaný typ ETB plazmidu, obsahující geny pro konjugaci a také nové varianty genů pro exfoliativní toxin B a další faktory virulence. Geny lokalizované v „core“ sekvenci linie I se u něj nevyskytují. Přestože se dosud předpokládalo, že ETB plazmidy jsou relativně uniformní, byl v této práci izolován a detailně popsán nový, sekvenčně zcela odlišný typ. Svými vlastnostmi tak reprezentuje novou dosud nepopsanou linii (II) ETB plazmidů, mající však velký vliv na patogenitu toxinogenních kmenů S. aureus.
Links
QJ1510216, research and development projectName: Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat (Acronym: StafyFag)
Investor: Ministry of Agriculture of the CR
PrintDisplayed: 3/5/2024 10:12