KEJNOVSKÁ, Iva, Klára BEDNÁŘOVÁ, Daniel RENČIUK, Zuzana DVOŘÁKOVÁ, Petra ŠKOLÁKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Radovan FIALA, Michaela VORLÍČKOVÁ a J. SAGI. Clustered abasic lesions profoundly change the structure and stability of human telomeric G-quadruplexes. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 45, č. 8, s. 4294-4305. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx191.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Clustered abasic lesions profoundly change the structure and stability of human telomeric G-quadruplexes
Autoři KEJNOVSKÁ, Iva (203 Česká republika), Klára BEDNÁŘOVÁ (203 Česká republika), Daniel RENČIUK (203 Česká republika), Zuzana DVOŘÁKOVÁ (203 Česká republika), Petra ŠKOLÁKOVÁ (203 Česká republika), Lukáš TRANTÍREK (203 Česká republika, garant, domácí), Radovan FIALA (203 Česká republika, domácí), Michaela VORLÍČKOVÁ (203 Česká republika) a J. SAGI (840 Spojené státy).
Vydání Nucleic Acids Research, Oxford, Oxford University Press, 2017, 0305-1048.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 11.561
Kód RIV RIV/00216224:14740/17:00095078
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx191
UT WoS 000400578600012
Klíčová slova anglicky DNA-DAMAGE CLUSTERS; K+ SOLUTION; GUANINE QUADRUPLEXES; IONIZING-RADIATION; BASE LESIONS; CELLS; 8-OXOGUANINE; SEQUENCE; TETRAD; SITES
Štítky OA, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 3. 2018 14:52.
Anotace
Ionizing radiation produces clustered damage to DNA which is difficult to repair and thus more harmful than single lesions. Clustered lesions have only been investigated in dsDNA models. Introducing the term 'clustered damage to G-quadruplexes' we report here on the structural effects of multiple tetrahydrofuranyl abasic sites replacing loop adenines (A/AP) and tetrad guanines (G/AP) in quadruplexes formed by the human telomere d[AG(3)(TTAG(3))(3)] (htel-22) and d[TAG(3)(TTAG(3))(3)TT] (htel-25) in K+ solutions. Single to triple A/APs increased the population of parallel strands in their structures by stabilizing propeller type loops, shifting the antiparallel htel-22 into hybrid or parallel quadruplexes. In htel-25, the G/APs inhibited the formation of parallel strands and these adopted antiparallel topologies. Clustered G/AP and A/APs reduced the thermal stability of the wild-type htel-25. Depending on position, A/APs diminished or intensified the damaging effect of the G/APs. Taken together, clustered lesions can disrupt the topology and stability of the htel quadruplexes and restrict their conformational space. These in vitro results suggest that formation of clustered lesions in the chromosome capping structure can result in the unfolding of existing G-quadruplexes which can lead to telomere shortening.
Návaznosti
GA13-28310S, projekt VaVNázev: Evolučně konzervované strukturní vlastnosti centromerické a telomerické DNA
Investor: Grantová agentura ČR, Evolucne konzervované strukturní vlastnosti centromerické a telomerické DNA
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 29. 8. 2024 00:35