J 2017

Self-assembled clusters of patchy rod-like molecules

JURÁSEK, Miroslav a Robert VÁCHA

Základní údaje

Originální název

Self-assembled clusters of patchy rod-like molecules

Autoři

JURÁSEK, Miroslav (203 Česká republika, domácí) a Robert VÁCHA (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

SOFT MATTER, CAMBRIDGE, ROYAL SOC CHEMISTRY, 2017, 1744-683X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10403 Physical chemistry

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 3.709

Kód RIV

RIV/00216224:14740/17:00095110

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

UT WoS

000413794700004

Klíčová slova anglicky

COILED-COIL; HARD SPHEROCYLINDERS; DESIGN

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 23. 3. 2018 13:37, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.

Anotace

V originále

The design of complex self-assembled structures remains a challenging task due to the intricate relationship between the properties of the building blocks and the final morphology of the aggregates. Here, we report such a relationship for rod-like particles with one or two attractive patches based on a combination of computer simulations and analytical theory. We investigated the formation of finite aggregates under various conditions and constructed structure diagrams, which can be used to determine and extrapolate the system composition. The size of the clusters is mainly determined by the size of the attractive patches and their geometrical arrangement. We showed that it is challenging to obtain clusters with more than four particles in high yields, and more complex building blocks or additional molecules would need to be used. Moreover, the particles with patch sizes close to the structure boundaries can switch between the aggregate state by a small change in conditions. These findings can be useful for the development of self-assembling building blocks and for the understanding of protein folds of coiled coils under various conditions.

Návaznosti

GA14-12598S, projekt VaV
Název: Samouspořádané systémy amfifilních peptiů (Akronym: SAAP)
Investor: Grantová agentura ČR, Self-assembly of amphiphilic peptides with helical character
LC06035, projekt VaV
Název: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu
LM2015085, projekt VaV
Název: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud
LQ1601, projekt VaV
Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020