GROCHALOVÁ, Martina, Hana KONEČNÁ, Karel STEJSKAL, David POTĚŠIL, Danuše FRIDRICHOVÁ, Eva SRBOVÁ, Kateřina ORNEROVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Deep coverage of the beer proteome. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2017, roč. 162, JUN, s. 119-124. ISSN 1874-3919. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jprot.2017.05.001.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Deep coverage of the beer proteome
Autoři GROCHALOVÁ, Martina (203 Česká republika, domácí), Hana KONEČNÁ (203 Česká republika, domácí), Karel STEJSKAL (203 Česká republika, domácí), David POTĚŠIL (203 Česká republika, domácí), Danuše FRIDRICHOVÁ (203 Česká republika, domácí), Eva SRBOVÁ (203 Česká republika, domácí), Kateřina ORNEROVÁ (203 Česká republika, domácí) a Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Journal of Proteomics, Amsterdam, ELSEVIER SCIENCE BV, 2017, 1874-3919.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.722
Kód RIV RIV/00216224:14740/17:00095139
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.jprot.2017.05.001
UT WoS 000404318500012
Klíčová slova anglicky Beer proteome; Gluten proteins; IPG-IEF; LC-MS/MS
Štítky CF PROT, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2018 09:23.
Anotace
We adopted an approach based on peptide immobilized pH gradient-isoelectric focusing (IPG-IEF) separation, coupled with LC-MS/MS, in order to maximize coverage of the beer proteome. A lager beer brewed using traditional Czech technology was degassed, desalted and digested. Tryptic peptides were separated by isoelectric focusing on an immobilized pH gradient strip and, after separation, the gel strip was divided into seven equally sized parts. Peptides extracted from gel fractions were analyzed by LC-MS/MS. This approach resulted in a three-fold increase in the number of proteins identified (over 1700) when compared to analysis of unfractionated beer processed by a filter-aided sample preparation (FASP). Over 1900 protein groups (PGs) in total were identified by both approaches.
Návaznosti
CZ.1.05/3.2.00/08.0144, interní kód MUNázev: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT - SC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud, 3.2 Propagace a informovanost
GBP206/12/G151, projekt VaVNázev: Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice
LM2015043, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 19. 7. 2024 12:17