Proteomic analyses of signalling complexes associated with
receptor tyrosine kinase identify novel members of fibroblast
growth factor receptor 3 interactome

J 2018

Proteomic analyses of signalling complexes associated with receptor tyrosine kinase identify novel members of fibroblast growth factor receptor 3 interactome

BÁLEK, Lukáš, Pavel NĚMEC, P. KONIK, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA et. al.

Základní údaje

Originální název

Proteomic analyses of signalling complexes associated with receptor tyrosine kinase identify novel members of fibroblast growth factor receptor 3 interactome

Autoři

BÁLEK, Lukáš (203 Česká republika, domácí), Pavel NĚMEC (203 Česká republika, domácí), P. KONIK (203 Česká republika), Michaela BOSÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Miroslav VAŘECHA (203 Česká republika, domácí), Iva GUDERNOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jiřina MEDALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Deborah KRAKOW (840 Spojené státy) a Pavel KREJČÍ (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Cellular Signalling, New York, Elsevier Science, 2018, 0898-6568

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10601 Cell biology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.388

Kód RIV

RIV/00216224:14110/18:00100747

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1016/j.cellsig.2017.10.003

UT WoS

000423893200015

Klíčová slova anglicky

FGFR3; Fibroblast growth factor; interactome; receptor tyrosine kinase; signal transduction

Štítky

14110513, EL OK, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 30. 4. 2019 09:13, Soňa Böhmová

Anotace

V originále

Receptor tyrosine kinases (RTKs) form multiprotein complexes that initiate and propagate intracellular signals and determine the RTK-specific signalling patterns. Unravelling the full complexity of protein interactions within the RTK-associated complexes is essential for understanding of RTK functions, yet it remains an understudied area of cell biology. We describe a comprehensive approach to characterize RTK interactome. A single tag immunoprecipitation and phosphotyrosine protein isolation followed by mass-spectrometry was used to identify proteins interacting with fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3). A total of 32 experiments were carried out in two different cell types and identified 66 proteins out of which only 20 (30.3%) proteins were already known FGFR interactors. Using co-immunoprecipitations, we validated FGFR3 interaction with adapter protein STAM1, transcriptional regulator SHOX2, translation elongation factor eEF1A1, serine/threonine kinases ICK, MAK and CCRK, and inositol phosphatase SHIP2. We show that unappreciated signalling mediators exist for well-studied RTKs, such as FGFR3, and may be identified via proteomic approaches described here. These approaches are easily adaptable to other RTKs, enabling identification of novel signalling mediators for majority of the known human RTKs.

Návaznosti

GA17-09525S, projekt VaV

Název: Neobvyklé signální dráhy lidských receptorových tyrozinových kináz

Investor: Grantová agentura ČR, Neobvyklé signální dráhy lidských receptorových tyrozinových kináz

LH15231, projekt VaV

Název: Nové mechanismy vzniku fatálních kostních ciliopatií u člověka

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Nové mechanizmy vzniku fatálních kostních ciliopatií u člověka

NV15-33232A, projekt VaV

Název: Identifikace nových možností léčby achondroplásie prostřednictvím analýzy interakce FGFR3 a adaptérového proteinu Frs2

NV15-34405A, projekt VaV

Název: Identifikace nových možností léčby chronické myeloidní leukémie pomocí systematické analýzy interaktomu proteinu BCR-ABL

ROZV/24/LF/2016, interní kód MU

Název: LF - Příspěvek IP 2016

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, LF - Příspěvek IP 2016

Citovat

BÁLEK, Lukáš, Pavel NĚMEC, P. KONIK, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Iva GUDERNOVÁ, Jiřina MEDALOVÁ, Deborah KRAKOW a Pavel KREJČÍ. Proteomic analyses of signalling complexes associated with receptor tyrosine kinase identify novel members of fibroblast growth factor receptor 3 interactome. Cellular Signalling. New York: Elsevier Science, 2018, roč. 42, JAN 2018, s. 144-154. ISSN 0898-6568. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cellsig.2017.10.003.

@article{1395567,
   author = {Bálek, Lukáš and Němec, Pavel and Konik, P. and Bosáková, Michaela and Vařecha, Miroslav and Gudernová, Iva and Medalová, Jiřina and Krakow, Deborah and Krejčí, Pavel},
   article_location = {New York},
   article_number = {JAN 2018},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.cellsig.2017.10.003},
   keywords = {FGFR3; Fibroblast growth factor; interactome; receptor tyrosine kinase; signal transduction},
   language = {eng},
   issn = {0898-6568},
   journal = {Cellular Signalling},
   title = {Proteomic analyses of signalling complexes associated with receptor tyrosine kinase identify novel members of fibroblast growth factor receptor 3 interactome},
   volume = {42},
   year = {2018}
}

TY  - JOUR
ID  - 1395567
AU  - Bálek, Lukáš - Němec, Pavel - Konik, P. - Bosáková, Michaela - Vařecha, Miroslav - Gudernová, Iva - Medalová, Jiřina - Krakow, Deborah - Krejčí, Pavel
PY  - 2018
TI  - Proteomic analyses of signalling complexes associated with receptor tyrosine kinase identify novel members of fibroblast growth factor receptor 3 interactome
JF  - Cellular Signalling
VL  - 42
IS  - JAN 2018
SP  - 144-154
EP  - 144-154
PB  - Elsevier Science
SN  - 08986568
KW  - FGFR3
KW  - Fibroblast growth factor
KW  - interactome
KW  - receptor tyrosine kinase
KW  - signal transduction
N2  - Receptor tyrosine kinases (RTKs) form multiprotein complexes that initiate and propagate intracellular signals and determine the RTK-specific signalling patterns. Unravelling the full complexity of protein interactions within the RTK-associated complexes is essential for understanding of RTK functions, yet it remains an understudied area of cell biology. We describe a comprehensive approach to characterize RTK interactome. A single tag immunoprecipitation and phosphotyrosine protein isolation followed by mass-spectrometry was used to identify proteins interacting with fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3). A total of 32 experiments were carried out in two different cell types and identified 66 proteins out of which only 20 (30.3%) proteins were already known FGFR interactors. Using co-immunoprecipitations, we validated FGFR3 interaction with adapter protein STAM1, transcriptional regulator SHOX2, translation elongation factor eEF1A1, serine/threonine kinases ICK, MAK and CCRK, and inositol phosphatase SHIP2. We show that unappreciated signalling mediators exist for well-studied RTKs, such as FGFR3, and may be identified via proteomic approaches described here. These approaches are easily adaptable to other RTKs, enabling identification of novel signalling mediators for majority of the known human RTKs.
ER  -

BÁLEK, Lukáš, Pavel NĚMEC, P. KONIK, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Iva GUDERNOVÁ, Jiřina MEDALOVÁ, Deborah KRAKOW a Pavel KREJČÍ. Proteomic analyses of signalling complexes associated with receptor tyrosine kinase identify novel members of fibroblast growth factor receptor 3 interactome. \textit{Cellular Signalling}. New York: Elsevier Science, 2018, roč.~42, JAN 2018, s.~144-154. ISSN~0898-6568. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cellsig.2017.10.003.

Podrobný výpis o publikaci