Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete
Genome Sequence and Metabolic Profiling

J 2017

Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling

SNOPKOVÁ, Kateřina, Karel SEDLÁŘ, Juraj BOSÁK, Eva CHALOUPKOVÁ, Ivo SEDLÁČEK et. al.

Základní údaje

Originální název

Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling

Autoři

SNOPKOVÁ, Kateřina (203 Česká republika, domácí), Karel SEDLÁŘ (203 Česká republika), Juraj BOSÁK (703 Slovensko, domácí), Eva CHALOUPKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Ivo PROVAZNÍK (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Evolutionary Bioinformatics, London, Sage Publications LTD, 2017, 1176-9343

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10602 Biology , Evolutionary biology

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 1.877

Kód RIV

RIV/00216224:14110/17:00095198

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1177/1176934317700863

UT WoS

000397968000001

Klíčová slova anglicky

Pragia fontium; Enterobacteriaceae; whole genome sequence; phylogeny; free-living bacteria

Štítky

EL OK, podil

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 18. 3. 2018 15:29, Soňa Böhmová

Anotace

V originále

Whole genome sequencing and metabolic fingerprinting confirmed the phylogenetic position of P. fontium inside the group of atypical H2S producers. Genomic data have revealed that P- fontium 24613 has limited pathogenic potential, although there are signs of genome decay. Although the lack of specific virulence factors and no association with a host species suggest a free-living style, the signs of genome decay suggest a proces of adaptation to an as-yet-unknown host.

Návaznosti

GA16-21649S, projekt VaV

Název: Molekulární charakterizace nových bakteriocinů identifikovaných v rodech Escherichia a Shigella

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární charakterizace nových bakteriocinů identifikovaných v rodech Escherichia a Shigella

MUNI/11/InGA04/2014, interní kód MU

Název: Alternativní antimikrobiální látky: studium vazby kolicinů na povrch patogenní bakterie

Investor: Masarykova univerzita, Alternativní antimikrobiální látky: studium vazby kolicinů na povrch patogenní bakterie

Citovat

SNOPKOVÁ, Kateřina, Karel SEDLÁŘ, Juraj BOSÁK, Eva CHALOUPKOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Ivo PROVAZNÍK a David ŠMAJS. Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling. Evolutionary Bioinformatics. London: Sage Publications LTD, 2017, roč. 13, č. 1176934317700863, s. 1-7. ISSN 1176-9343. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1177/1176934317700863.

@article{1396379,
   author = {Snopková, Kateřina and Sedlář, Karel and Bosák, Juraj and Chaloupková, Eva and Sedláček, Ivo and Provazník, Ivo and Šmajs, David},
   article_location = {London},
   article_number = {1176934317700863},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1177/1176934317700863},
   keywords = {Pragia fontium; Enterobacteriaceae; whole genome sequence; phylogeny; free-living bacteria},
   language = {eng},
   issn = {1176-9343},
   journal = {Evolutionary Bioinformatics},
   title = {Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling},
   volume = {13},
   year = {2017}
}

TY  - JOUR
ID  - 1396379
AU  - Snopková, Kateřina - Sedlář, Karel - Bosák, Juraj - Chaloupková, Eva - Sedláček, Ivo - Provazník, Ivo - Šmajs, David
PY  - 2017
TI  - Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling
JF  - Evolutionary Bioinformatics
VL  - 13
IS  - 1176934317700863
SP  - 1-7
EP  - 1-7
PB  - Sage Publications LTD
SN  - 11769343
KW  - Pragia fontium
KW  - Enterobacteriaceae
KW  - whole genome sequence
KW  - phylogeny
KW  - free-living bacteria
N2  - Whole genome sequencing and metabolic fingerprinting confirmed the phylogenetic position of P. fontium inside the group of atypical H2S producers. Genomic data have revealed that P- fontium 24613 has limited pathogenic potential, although there are signs of genome decay. Although the lack of specific virulence factors and no association with a host species suggest a free-living style, the signs of genome decay suggest a proces of adaptation to an as-yet-unknown host.
ER  -

SNOPKOVÁ, Kateřina, Karel SEDLÁŘ, Juraj BOSÁK, Eva CHALOUPKOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Ivo PROVAZNÍK a David ŠMAJS. Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling. \textit{Evolutionary Bioinformatics}. London: Sage Publications LTD, 2017, roč.~13, č.~1176934317700863, s.~1-7. ISSN~1176-9343. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1177/1176934317700863.

Podrobný výpis o publikaci