2017
MicroRNA and mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis: Whole miRNome profiling of human hippocampus
BENCÚROVÁ, Petra, Jiří BALOUN, Kateřina MUSILOVÁ, Lenka RADOVÁ, Boris TICHÝ et. al.Základní údaje
Originální název
MicroRNA and mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis: Whole miRNome profiling of human hippocampus
Název česky
MikroRNA a mesiotemporální epilepsie s hipokampální sklerózou: Profilování celého miRNomu v lidském hipokampu
Autoři
BENCÚROVÁ, Petra (703 Slovensko, domácí), Jiří BALOUN (203 Česká republika, domácí), Kateřina MUSILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lenka RADOVÁ (203 Česká republika, domácí), Boris TICHÝ (203 Česká republika, domácí), Martin PAIL (203 Česká republika, domácí), Martin ZEMAN (203 Česká republika, domácí), Eva BRICHTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Markéta HERMANOVÁ (203 Česká republika, domácí), Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Marek MRÁZ (203 Česká republika, domácí) a Milan BRÁZDIL (203 Česká republika, garant, domácí)
Vydání
Epilepsia, Blackwell Science, 2017, 0013-9580
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
30100 3.1 Basic medicine
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 5.067
Kód RIV
RIV/00216224:14740/17:00095206
Organizační jednotka
Středoevropský technologický institut
UT WoS
000412197300016
Klíčová slova česky
mesiotemporální epilepsie; miRNA profilování; NGS; miQPCR; hipokampální skleróza; predikce cílů
Klíčová slova anglicky
Mesial temporal lobe epilepsy; MicroRNA profiling; NGS; miQPCR; Hippocampal sclerosis; Target prediction
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 12. 4. 2018 10:57, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.
V originále
Objective: Mesial temporal lobe epilepsy (mTLE) is a severe neurological disorder characterized by recurrent seizures. mTLE is frequently accompanied by neurodegeneration in the hippocampus resulting in hippocampal sclerosis (HS), the most common morphological correlate of drug resistance in mTLE patients. Incomplete knowledge of pathological changes in mTLE+HS complicates its therapy. The pathological mechanism underlying mTLE+HS may involve abnormal gene expression regulation, including posttranscriptional networks involving microRNAs (miRNAs). miRNA expression deregulation has been reported in various disorders, including epilepsy. However, the miRNA profile of mTLE+HS is not completely known and needs to be addressed. Methods: Here, we have focused on hippocampal miRNA profiling in 33 mTLE+HS patients and nine postmortem controls to reveal abnormally expressed miRNAs. In this study, we significantly reduced technology-related bias (the most common source of false positivity in miRNA profiling data) by combining two different miRNA profiling methods, namely next generation sequencing and miRNA-specific quantitative real-time polymerase chain reaction. Results: These methods combined have identified and validated 20 miRNAs with altered expression in the human epileptic hippocampus; 19 miRNAs were up-regulated and one down-regulated in mTLE+HS patients. Nine of these miRNAs have not been previously associated with epilepsy, and 19 aberrantly expressed miRNAs potentially regulate the targets and pathways linked with epilepsy (such as potassium channels, gama-aminobutyric acid, neurotrophin signaling, and axon guidance). Significance: This study extends current knowledge of miRNA-mediated gene expression regulation in mTLE+HS by identifying miRNAs with altered expression in mTLE+HS, including nine novel abnormally expressed miRNAs and their putative targets. These observations further encourage the potential of microRNA-based biomarkers or therapies.
Česky
Cíle: Mesiotemporální epilepsie (mTLE) je závažné neurologické onemocnění projevující se opakovanými záchvaty. mTLE je často doprovázená poškozením hipokampálních neuronů vedoucím ke vzniku hipokampální sklerózy (HS), nejčastějšího morfologického korelátu rezistence k léčbě u mTLE pacientů. Neúplná znalost patologických změn v mTLE+HS komplikuje terapii. Mezi patologické mechanizmy zapojené do mTLE+HS se může radit abnormální regulace genové exprese, včetně posttranskripčních drah zahrnujících mikroRNA(miRNA). Změny v expresi miRNA jsou spájený s různými onemocněními včetně epilepsie. miRNA profil u mTLE+HS, však není doposud důkladně prozkoumán a je proto potřeba se na něj zaměřit. Metody: Zaměřili jsme se na profilování miRNA v hipokampu 33 pacientů s mTLE+HS a devíti post mortem kontrol, za účelem odhalit abnormálně exprimované miRNA. V této práci jsme značně snížili technickou chybu analýzy (nejčastější zdroj falešné pozitivity v profilování miRNA) kombinací dvou rozdílných metod stanovení profilů miRNA, konkrétně sekvenace nové generace a polymerázové řetězové reakce v reálním čase specificky navržené k analýze miRNA. Výsledky: Kombinací těchto metod bylo identifikováno a validováno 20 miRNA se změněnou expresí v lidském epileptickém hipokampu; 19 miRNA mělo zvýšenou expresi a jedna byla snížená u mTLE+HS pacientů. Devět z těchto miRNA bylo v minulosti asociováno s epilepsii a 19 miRNA se změněnou expresí potenciálně regulují cíle a dráhy spájené s epilepsii (jako jsou sodíkové kanály, gama-amino máslová kyselina, neurotrofinová signalizace a směrování axonů) Význam: Tato práce rozšiřuje současné poznání v oblasti regulace genové exprese pomocí miRNA v mTLE+HS, identifikací miRNA se změněnou expresí v mTLE+HS, včetně devíti dosud neobjevených miRNA se změněnou expresí a jejích předpokládaných cílů. Tyto informace podporují předpoklad vzniku diagnostických markérů a terapie na bázi miRNA.
Návaznosti
| GA16-04726S, projekt VaV |
| ||
| LM2015091, projekt VaV |
| ||
| LQ1601, projekt VaV |
| ||
| MUNI/A/1044/2015, interní kód MU |
|