a 2017

Influence of non-Watson-Crick base pairing on structure of DNA

BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK, Viktor ILLÍK a Petr KULHÁNEK

Základní údaje

Originální název

Influence of non-Watson-Crick base pairing on structure of DNA

Autoři

BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK, Viktor ILLÍK a Petr KULHÁNEK

Vydání

Modeling Interactions in Biomolecules VIII, Plzeň, Czech Republic, 3-8 September 2017, 2017

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství
Změněno: 2. 3. 2020 15:57, Mgr. Marie Šípková, DiS.

Anotace

V originále

This study is focused on structural properties DNA. Studied structure is 13 base pairs long palindromic DNA with all combination of base pairs in the middle of structure. We have analyzed free energy surfaces created using ABF molecular dynamics with chosen collective variable. We extracted structures around locals minima of these free energy surfaces to run QM/MM structure optimizations followed by AIM analyses of central base pairs of the DNA structures.

Návaznosti

ED1.1.00/02.0068, projekt VaV
Název: CEITEC - central european institute of technology