J 2017

Enzyme Tunnels and Gates As Relevant Targets in Drug Design

MARQUES, Sérgio Manuel, Lukáš DANIEL, Tomáš BURYŠKA, Zbyněk PROKOP, Jan BREZOVSKÝ et. al.

Základní údaje

Originální název

Enzyme Tunnels and Gates As Relevant Targets in Drug Design

Autoři

MARQUES, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí), Lukáš DANIEL (203 Česká republika, domácí), Tomáš BURYŠKA (203 Česká republika, domácí), Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí), Jan BREZOVSKÝ (203 Česká republika, domácí) a Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

MEDICINAL RESEARCH REVIEWS, Hoboken, USA, WILEY, 2017, 0198-6325

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30104 Pharmacology and pharmacy

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 8.290

Kód RIV

RIV/00216224:14310/17:00095541

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

UT WoS

000406877600003

Klíčová slova anglicky

drug design; protein tunnels; protein gates; drug binding; selectivity; specificity

Štítky

Změněno: 3. 4. 2018 14:38, Ing. Nicole Zrilić

Anotace

V originále

Many enzymes contain tunnels and gates that are essential to their function. Gates reversibly switch between open and closed conformations and thereby control the traffic of small molecules-substrates, products, ions, and solvent molecules-into and out of the enzyme's structure via molecular tunnels. Many transient tunnels and gates undoubtedly remain to be identified, and their functional roles and utility as potential drug targets have received comparatively little attention. Here, we describe a set of general concepts relating to the structural properties, function, and classification of these interesting structural features. In addition, we highlight the potential of enzyme tunnels and gates as targets for the binding of small molecules. The different types of binding that are possible and the potential pharmacological benefits of such targeting are discussed. Twelve examples of ligands bound to the tunnels and/or gates of clinically relevant enzymes are used to illustrate the different binding modes and to explain some new strategies for drug design. Such strategies could potentially help to overcome some of the problems facing medicinal chemists and lead to the discovery of more effective drugs.

Návaznosti

GA16-06096S, projekt VaV
Název: Objasnění významu dynamických tunelů pro enzymatickou katalýzu: simulace a fluorescenční experimenty
Investor: Grantová agentura ČR, Objasnění významu dynamických tunelů pro enzymatickou katalýzu: simulace a fluorescenční experimenty
GA16-07965S, projekt VaV
Název: Řízená evoluce dynamických elementů v enzymech s využitím mikrofluidních čipů
Investor: Grantová agentura ČR, Řízená evoluce dynamických elementů v enzymech s využitím mikrofluidních čipů
LH14027, projekt VaV
Název: Nové koncepty a nástroje pro racionální design enzymů
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Nové koncepty a nástroje pro racionální design enzymů
LM2015051, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX RI)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumná infrastruktura RECETOX
LO1214, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí
4SGA8519, interní kód MU
Název: Rational design and engineering of enzyme gates (Akronym: BIOGATE)
Investor: Jihomoravský kraj, Rational design and engineering of enzyme gates, Granty pro zahraniční vědce