MAZURENKO, Stanislav, Antonín KUNKA, Koen BEERENS, Christopher JOHNSON, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. CalFitter 1.0. 2017.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název CalFitter 1.0
Autoři MAZURENKO, Stanislav (643 Rusko, domácí), Antonín KUNKA (203 Česká republika, domácí), Koen BEERENS (56 Belgie, domácí), Christopher JOHNSON (826 Velká Británie a Severní Irsko), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí) a Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí).
Vydání 2017.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Software
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14310/17:00100391
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky Protein stability; CalFitter; Calorimetry; DSC; protein unfolding; re-heating
Technické parametry licenční smlouva není
Změnil Změnila: Mgr. Martina Damborská, učo 8324. Změněno: 16. 3. 2018 07:59.
Anotace
Differential scanning calorimetry (DSC) is an invaluable tool for studying protein thermal denaturation. Currently, however, no software enabling complex analysis of the resulting thermograms in a user-friendly manner is available. To address this, we have developed MatLab-based software called CalFitter which allows fitting of DSC curves into 10 models of unfolding including different number of intermediates, reversible and irreversible transitions and their combination. Moreover, it allows simultaneous fitting of DSC scans together with re-heating traces collected after termination of the first run at different temperatures. CalFitter output can be exported to single excel file that includes quantitative description of unfolding model in terms of number of intermediates, energy parameters of each transition with statistical information and fraction of protein states calculated based on the model.
VytisknoutZobrazeno: 14. 7. 2024 23:40