2017
BCSgen: Biochemical Space language software tool
TROJÁK, Matej, David ŠAFRÁNEK a Jakub ŠALAGOVIČZákladní údaje
Originální název
BCSgen: Biochemical Space language software tool
Název česky
BCSgen: Softvérová podpora pre jazyk Biochemického priestoru
Autoři
TROJÁK, Matej (703 Slovensko, domácí), David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, domácí) a Jakub ŠALAGOVIČ (703 Slovensko, domácí)
Vydání
2017
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Software
Obor
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Kód RIV
RIV/00216224:14330/17:00101020
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
Klíčová slova anglicky
systems biology; rule-based language; analysis
Technické parametry
Python, desktopová aplikace
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 25. 4. 2019 16:13, RNDr. Matej Troják, Ph.D.
V originále
BCSgen is a software providing basic functionality to write, maintain, and analyse models written in Biochemical Space Language (BCSL). The key features of the tool are: interactive editor which allows users to create and load models providing automatic syntax highlighting and errors reporting; transition system analysis allows to generate transition system for a given model and consequently analyse it (e.g. perform reachability analysis); simulation of a model with defined kinetic rates with either deterministic or stochastic approach; visualisation of simulated data in an interactive plot chart and visualisation of transition system in a web-based visualisation for exploration of whole space.
Česky
BCSgen je nástroj poskytujúci funkcionalitu na písanie, udržiavanie a analyzovanie modelov zapísaných v jazyku Biochemického priestoru.
Návaznosti
| GA15-11089S, projekt VaV |
| ||
| LM2015055, projekt VaV |
|