J 2018

Analysis of binding interfaces of the human scaffold protein AXIN1 by peptide microarrays

HARNOŠ, Jakub, Jan RYNEŠ, Pavlína VÍŠKOVÁ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Lola Murielle BAJARD ÉP.ESNER et. al.

Základní údaje

Originální název

Analysis of binding interfaces of the human scaffold protein AXIN1 by peptide microarrays

Autoři

HARNOŠ, Jakub (203 Česká republika, domácí), Jan RYNEŠ (203 Česká republika, domácí), Pavlína VÍŠKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Silvie TRANTÍRKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lola Murielle BAJARD ÉP.ESNER (250 Francie, domácí), Lukáš TRANTÍREK (203 Česká republika, domácí) a Vítězslav BRYJA (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Journal of Biological Chemistry, Bethesda, USA, Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol. 2018, 0021-9258

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 4.106

Kód RIV

RIV/00216224:14310/18:00101698

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

UT WoS

000447833600018

Klíčová slova anglicky

peptide array; scaffold protein; axin; serine; threonine protein kinase; p53; Myc (c-Myc); casein kinase 1E; dishevelled; intrinsically disordered region; Wnt pathway

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 26. 3. 2019 13:07, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.

Anotace

V originále

Intrinsically disordered regions (IDRs) are protein regions that lack persistent secondary or tertiary structure under native conditions. IDRs represent >40% of the eukaryotic proteome and play a crucial role in protein-protein interactions. The classical approach for identification of these interaction interfaces is based on mutagenesis combined with biochemical techniques such as coimmunoprecipitation or yeast two-hybrid screening. This approach either provides information of low resolution (large deletions) or very laboriously tries to precisely define the binding epitope via single amino acid substitutions. Here, we report the use of a peptide microarray based on the human scaffold protein AXIN1 for high-throughput and -resolution mapping of binding sites for several AXIN1 interaction partners in vitro. For each of the AXIN1-binding partners tested, i.e. casein kinase 1 E (CK1E); c-Myc; peptidyl-prolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 (Pin1); and p53, we found at least three different epitopes, predominantly in the central IDR of AXIN1. We functionally validated the specific AXIN1-CK1E interaction identified here with epitope-mimicking peptides and with AXIN1 variants having deletions of short binding epitopes. On the basis of these results, we propose a model in which AXIN1 competes with dishevelled (DVL) for CK1E and regulates CK1E-induced phosphorylation of DVL and activation of Wnt/-catenin signaling.

Návaznosti

GA17-12075S, projekt VaV
Název: Polymorfní G-quadruplexy v promotorových oblastech genů
Investor: Grantová agentura ČR, Polymorfní G-quadruplexy v promotorových oblastech genů
GA18-17658S, projekt VaV
Název: Odhalení tajemství signální dráhy WNT analýzou struktury proteinu Dishevelled
Investor: Grantová agentura ČR, Odhalení tajemství signální dráhy WNT analýzou struktury proteinu Dishevelled
GJ15-22380Y, projekt VaV
Název: Molekulární stavba protein-DNA komplexů zapojených v opravě nukleotidových sestřihů
Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární stavba protein-DNA komplexů zapojených v opravě nukleotidových sestřihů
LQ1601, projekt VaV
Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
MUNI/A/1145/2017, interní kód MU
Název: Podpora výzkumné činnosti studentů v oblasti fyziologie, vývojové biologie a imunologie živočichů v roce 2018 (Akronym: OFIŽ 2018)
Investor: Masarykova univerzita, Podpora výzkumné činnosti studentů v oblasti fyziologie, vývojové biologie a imunologie živočichů v roce 2018, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/G/1100/2016, interní kód MU
Název: Computational chemistry for Wnt signaling pathway
Investor: Masarykova univerzita, Computational chemistry for Wnt signaling pathway, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
NV15-34405A, projekt VaV
Název: Identifikace nových možností léčby chronické myeloidní leukémie pomocí systematické analýzy interaktomu proteinu BCR-ABL