J 2018

Functional Characterization of SMG7 Paralogs in Arabidopsis thaliana

CAPITAO, C., Neha SHUKLA, Aneta WANDROLOVÁ, O.M. SCHEID, Karel ŘÍHA et. al.

Základní údaje

Originální název

Functional Characterization of SMG7 Paralogs in Arabidopsis thaliana

Autoři

CAPITAO, C. (40 Rakousko), Neha SHUKLA (356 Indie, domácí), Aneta WANDROLOVÁ (203 Česká republika, domácí), O.M. SCHEID (40 Rakousko) a Karel ŘÍHA (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Frontiers in Plant Science, Lausanne (Switzerland), Frontiers Media SA, 2018, 1664-462X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10611 Plant sciences, botany

Stát vydavatele

Švýcarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 4.106

Kód RIV

RIV/00216224:14740/18:00101791

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

UT WoS

000449282400001

Klíčová slova anglicky

nonsense mediated RNA decay; meiosis; SMG7; gene duplication; Arabidopsis

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 19. 3. 2019 14:38, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.

Anotace

V originále

SMG7 proteins are evolutionary conserved across eukaryotes and primarily known for their function in nonsense mediated RNA decay (NMD). In contrast to other NMD factors, SMG7 proteins underwent independent expansions during evolution indicating their propensity to adopt novel functions. Here we characterized SMG7 and SMG7-like (SMG7L) paralogs in Arabidopsis thaliana. SMG7 retained its role in NMD and additionally appears to have acquired another function in meiosis. We inactivated SMG7 by CRISPR/Cas9 mutagenesis and showed that, in contrast to our previous report, SMG7 is not an essential gene in Arabidopsis. Furthermore, our data indicate that the N-terminal phosphoserine-binding domain is required for both NMD and meiosis. Phenotypic analysis of SMG7 and SMG7L double mutants did not indicate any functional redundancy between the two genes, suggesting neofunctionalization of SMG7L. Finally, protein sequence comparison together with a phenotyping of T-DNA insertion mutants identified several conserved regions specific for SMG7 that may underlie its role in NMD and meiosis. This information provides a framework for deciphering the non-canonical functions of SMG7-family proteins.

Návaznosti

EF15_003/0000479, projekt VaV
Název: Regulace rostlinné meiózy
GA16-18578S, projekt VaV
Název: Funkce UPF1 helikázy v procesech odehrávajících se v buněčném jádře
Investor: Grantová agentura ČR, Funkce UPF1 helikázy v procesech odehrávajících se v buněčném jádře