Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
@proceedings{1538777, author = {Baráková, Alžběta and Gelbíčová, Tereza and Florianová, Martina and Karpíšková, Renata}, booktitle = {Tomáškovy dny mladých mikrobiologů}, isbn = {978-80-210-9296-9}, title = {Výskyt plazmidově vázané rezistence ke kolistinu u bakterií z odpadních vod v České republice}, year = {2019} }
TY - CONF ID - 1538777 AU - Baráková, Alžběta - Gelbíčová, Tereza - Florianová, Martina - Karpíšková, Renata PY - 2019 TI - Výskyt plazmidově vázané rezistence ke kolistinu u bakterií z odpadních vod v České republice SN - 9788021092969 N2 - Voda z čistírny odpadních vod (ČOV) může sloužit jako rezervoár bakterií rezistentních k antimikrobikům, včetně kolistinu využívanému k léčbě infekcí vyvolaných multirezistentními gram-negativními bakteriemi. Sledování genů rezistence v odpadních vodách napomáhá predikovat výskyt bakterií rezistentních k antimikrobiálním látkám v populaci lidí, zvířat a prostředí. Cílem této pilotní studie bylo sledovat výskyt genů mcr kódujících plazmidově vázanou rezistenci ke kolistinu v odpadních vodách ČR, detekovat tyto bakterie a blíže je charakterizovat. Celkem bylo vyšetřeno 14 vzorků odpadních vod pocházejících z ČOV v Jihomoravském (n=11) a Středočeském kraji (n=3) odebraných v letech 2018 – 2019 (březen). 25 ml vzorku bylo pomnoženo v pufrované peptonové vodě a inkubováno při 37 °C přes noc. Poté byla izolována celková DNA a metodou PCR detekovány geny mcr-1 až mcr-8. Současně byla provedena inokulace na Brilliance UTI Clarity agar s přídavkem kolistinu (3,5 mg/L). Získané izoláty byly identifikovány metodou hmotnostní spektrometrie (MALDI-TOF MS) a přítomnost genů mcr byla ověřena metodou PCR. U vybraných izolátů (n=7) byla provedena celogenomová sekvenace (WGS) a detailní analýza genomu (MLST, serotyp, rezistence, přítomnost a charakterizace plazmidů). Všechny vzorky odpadních vod byly po izolaci celkové DNA pozitivní na výskyt některého z mcr genů. Nejčastěji byl detekován gen mcr-1 (13/14) a dále geny mcr-4, mcr-5, mcr-3 a mcr-8 (10/14, 9/14, 8/14 a 1/14). Geny mcr-2, mcr-6 a mcr-7 nebyly v testovaných vzorcích prokázány. Pouze z osmi (57 %) vzorků byly izolovány bakterie nesoucí některý ze sledovaných genů. Bylo získáno 10 izolátů E. coli nesoucích gen mcr-1 a dva izoláty Aeromonas spp. s genem mcr-3. Výsledky WGS prokázaly vysokou heterogenitu (MLST i serotypu) a multirezistenci u testovaných izolátů E. coli. Gen mcr-1 bylo možné lokalizovat u šesti E. coli na plazmidech typu IncX4 (n=4), IncI2 (n=1) a IncP1 (n=1). Výsledky studie potvrzují rozšíření plazmidově vázané rezistence ke kolistinu u bakterií v odpadních vodách v ČR. Možnost horizontálního šíření genů mcr v odpadních vodách a dále ve vnějším prostředí může představovat hrozbu pro veřejné zdraví. ER -
BARÁKOVÁ, Alžběta, Tereza GELBÍČOVÁ, Martina FLORIANOVÁ a Renata KARPÍŠKOVÁ. Výskyt plazmidově vázané rezistence ke kolistinu u bakterií z odpadních vod v České republice. In \textit{Tomáškovy dny mladých mikrobiologů}. 2019. ISBN~978-80-210-9296-9.
|