J 2019

Capability of Fluorescent Capillary Electrophoresis To Distinguish Species of the Candida parapsilosis Complex

KOTÁSKOVÁ, Iva, Hana OBRUČOVÁ, Veronika LÝČKOVÁ, Filip RŮŽIČKA, Tomáš FREIBERGER et. al.

Základní údaje

Originální název

Capability of Fluorescent Capillary Electrophoresis To Distinguish Species of the Candida parapsilosis Complex

Autoři

KOTÁSKOVÁ, Iva (203 Česká republika, domácí), Hana OBRUČOVÁ (203 Česká republika), Veronika LÝČKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Filip RŮŽIČKA (203 Česká republika, domácí) a Tomáš FREIBERGER (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Journal of Clinical Microbiology, Washington, American Society for Microbiology, 2019, 0095-1137

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10606 Microbiology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 5.897

Kód RIV

RIV/00216224:14110/19:00108483

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

UT WoS

000466042600008

Klíčová slova anglicky

Candida; Candida parapsilosis complex; MALDI-TOF; fluorescent capillary electrophoresis; fungi

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 4. 6. 2020 08:39, Mgr. Tereza Miškechová

Anotace

V originále

Candida parapsilosis complex (psilosis complex) has three genetically distinct but not easily phenotypically distinguishable cryptic species, C. parapsilosis sensu stricto, Candida metapsilosis, and C. orthopsilosis. It has been reported as one of the most important non-albicans agents commonly detected in invasive candidiasis (1–3). Each psilosis complex species manifests a unique epidemiology, virulence, and antifungal susceptibility (4); thus, precise identification can be of clinical interest, and various molecular methods are being developed (5–7). Our previous studies (5, 8) reported the capability of ITS2 ribosomal DNA (rDNA) amplification followed by fluorescent capillary electrophoresis (f-ITS2-PCR-CE) to distinguish between various Candida species, including psilosis complex, by a small but constant 0.4-bp difference between C. parapsilosis and Candida orthopsilosis. The actual positions of the size standard fragments are plotted against the expected size of each size standard fragment, which defines the function of these variables. The size (bp) of an analyzed fragment is then calculated according to this function; therefore, decimal values are being reported. The 0.4-bp size difference is presumably caused by the different mobilities of singlestranded DNA (ssDNA) fragments, resulting from their different primary structures.

Návaznosti

MUNI/A/0925/2017, interní kód MU
Název: Poruchy tvorby protilátek a komplementového systému
Investor: Masarykova univerzita, Poruchy tvorby protilátek a komplementového systému, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1189/2018, interní kód MU
Název: Původci nozokomiálních nákaz a možnosti jejich diagnostiky a terapie (Akronym: PNNMDT)
Investor: Masarykova univerzita, Původci nozokomiálních nákaz a možnosti jejich diagnostiky a terapie, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1298/2018, interní kód MU
Název: Vrozené a získané deficience imunitního systému (Akronym: Poruchy imunity)
Investor: Masarykova univerzita, Vrozené a získané deficience imunitního systému, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
NV16-31593A, projekt VaV
Název: Polymikrobiální biofilm jako komplexní mikrobiom v rámci léčby nozokomiálních infekcí