Telomerase RNAs in land plants

J 2019

Telomerase RNAs in land plants

FAJKUS, Petr, Vratislav PEŠKA, Michal ZÁVODNÍK, Miloslava FOJTOVÁ, Jana FULNEČKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Telomerase RNAs in land plants

Autoři

FAJKUS, Petr (203 Česká republika, domácí), Vratislav PEŠKA (203 Česká republika), Michal ZÁVODNÍK (203 Česká republika, domácí), Miloslava FOJTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jana FULNEČKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Šimon DOBIAS (703 Slovensko, domácí), Agata Magdalena KILAR (616 Polsko, domácí), Martina DVOŘÁČKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Dagmar ZACHOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivona NEČASOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jason SIMS (40 Rakousko), Eva SÝKOROVÁ (203 Česká republika) a Jiří FAJKUS (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Nucleic acids research, Oxford, Oxford University Press, 2019, 0305-1048

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10611 Plant sciences, botany

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Webová stránka článku v časopise NAR

Impakt faktor

Impact factor: 11.502

Kód RIV

RIV/00216224:14740/19:00107675

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz695

UT WoS

000491241400037

Klíčová slova anglicky

Telomerase RNA subunit; plant

Štítky

CF CELLIM, CF GEN, CF PLANT, Plant telomerase RNAs, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 15. 10. 2024 09:11, Ing. Martina Blahová

Anotace

V originále

To elucidate the molecular nature of evolutionary changes of telomeres in the plant order Asparagales, we aimed to characterize telomerase RNA subunits (TRs) in these plants. The unusually long telomere repeat unit in Allium plants (12 nt) allowed us to identify TRs in transcriptomic data of representative species of the Allium genus. Orthologous TRs were then identified in Asparagales plants harbouring telomere DNA composed of TTAGGG (human type) or TTTAGGG (Arabidopsis-type) repeats. Further, we identified TRs across the land plant phylogeny, including common model plants, crop plants, and plants with unusual telomeres. Several lines of functional testing demonstrate the templating telomerase function of the identified TRs and disprove a functionality of the only previously reported plant telomerase RNA in Arabidopsis thaliana. Importantly, our results change the existing paradigm in plant telomere biology which has been based on the existence of a relatively conserved telomerase reverse transcriptase subunit (TERT) associating with highly divergent TRs even between closely related plant taxa. The finding of a monophyletic origin of genuine TRs across land plants opens the possibility to identify TRs directly in transcriptomic or genomic data and/or predict telomere sequences synthesized according to the respective TR template region.

Návaznosti

ATCZ40, interní kód MU

Název: Creating synergies between research infrastructures to stimulate innovation in the cross-border region (Akronym: RIAT-CZ)

Investor: Ministerstvo pro místní rozvoj ČR, Creating synergies between research infrastructures to stimulate innovation in the cross-border region

GA17-09644S, projekt VaV

Název: Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales

LQ1601, projekt VaV

Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020

90062, velká výzkumná infrastruktura

Název: Czech-BioImaging

90091, velká výzkumná infrastruktura

Název: NCMG

Citovat

FAJKUS, Petr, Vratislav PEŠKA, Michal ZÁVODNÍK, Miloslava FOJTOVÁ, Jana FULNEČKOVÁ, Šimon DOBIAS, Agata Magdalena KILAR, Martina DVOŘÁČKOVÁ, Dagmar ZACHOVÁ, Ivona NEČASOVÁ, Jason SIMS, Eva SÝKOROVÁ a Jiří FAJKUS. Telomerase RNAs in land plants. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, č. 18, s. 9842-9856. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz695.

@article{1561456,
   author = {Fajkus, Petr and Peška, Vratislav and Závodník, Michal and Fojtová, Miloslava and Fulnečková, Jana and Dobias, Šimon and Kilar, Agata Magdalena and Dvořáčková, Martina and Zachová, Dagmar and Nečasová, Ivona and Sims, Jason and Sýkorová, Eva and Fajkus, Jiří},
   article_location = {Oxford},
   article_number = {18},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz695},
   keywords = {Telomerase RNA subunit; plant},
   language = {eng},
   issn = {0305-1048},
   journal = {Nucleic acids research},
   title = {Telomerase RNAs in land plants},
   url = {https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz695/5545009},
   volume = {47},
   year = {2019}
}

TY  - JOUR
ID  - 1561456
AU  - Fajkus, Petr - Peška, Vratislav - Závodník, Michal - Fojtová, Miloslava - Fulnečková, Jana - Dobias, Šimon - Kilar, Agata Magdalena - Dvořáčková, Martina - Zachová, Dagmar - Nečasová, Ivona - Sims, Jason - Sýkorová, Eva - Fajkus, Jiří
PY  - 2019
TI  - Telomerase RNAs in land plants
JF  - Nucleic acids research
VL  - 47
IS  - 18
SP  - 9842-9856
EP  - 9842-9856
PB  - Oxford University Press
SN  - 03051048
KW  - Telomerase RNA subunit
KW  - plant
UR  - https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz695/5545009
L2  - https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz695/5545009
N2  - To elucidate the molecular nature of evolutionary changes of telomeres in the plant order Asparagales, we aimed to characterize telomerase RNA subunits (TRs) in these plants. The unusually long telomere repeat unit in Allium plants (12 nt) allowed us to identify TRs in transcriptomic data of representative species of the Allium genus. Orthologous TRs were then identified in Asparagales plants harbouring telomere DNA composed of TTAGGG (human type) or TTTAGGG (Arabidopsis-type) repeats. Further, we identified TRs across the land plant phylogeny, including common model plants, crop plants, and plants with unusual telomeres. Several lines of functional testing demonstrate the templating telomerase function of the identified TRs and disprove a functionality of the only previously reported plant telomerase RNA in Arabidopsis thaliana. Importantly, our results change the existing paradigm in plant telomere biology which has been based on the existence of a relatively conserved telomerase reverse transcriptase subunit (TERT) associating with highly divergent TRs even between closely related plant taxa. The finding of a monophyletic origin of genuine TRs across land plants opens the possibility to identify TRs directly in transcriptomic or genomic data and/or predict telomere sequences synthesized according to the respective TR template region.
ER  -

FAJKUS, Petr, Vratislav PEŠKA, Michal ZÁVODNÍK, Miloslava FOJTOVÁ, Jana FULNEČKOVÁ, Šimon DOBIAS, Agata Magdalena KILAR, Martina DVOŘÁČKOVÁ, Dagmar ZACHOVÁ, Ivona NEČASOVÁ, Jason SIMS, Eva SÝKOROVÁ a Jiří FAJKUS. Telomerase RNAs in land plants. \textit{Nucleic acids research}. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč.~47, č.~18, s.~9842-9856. ISSN~0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz695.

Podrobný výpis o publikaci