MICHÁLEK, Jan, Karel ŠTĚPKA, Michal KOZUBEK, Jarmila NAVRÁTILOVÁ, Barbora PAVLATOVSKÁ, Markéta MACHÁLKOVÁ, Jan PREISLER a Adam PRUŠKA. Quantitative Assessment of Anti-Cancer Drug Efficacy From Coregistered Mass Spectrometry and Fluorescence Microscopy Images of Multicellular Tumor Spheroids. Microscopy and Microanalysis. Cambridge University Press, 2019, roč. 25, č. 6, s. 1311-1322. ISSN 1431-9276. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1017/S1431927619014983.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Quantitative Assessment of Anti-Cancer Drug Efficacy From Coregistered Mass Spectrometry and Fluorescence Microscopy Images of Multicellular Tumor Spheroids
Autoři MICHÁLEK, Jan (203 Česká republika, garant, domácí), Karel ŠTĚPKA (203 Česká republika, domácí), Michal KOZUBEK (203 Česká republika, domácí), Jarmila NAVRÁTILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Barbora PAVLATOVSKÁ (203 Česká republika, domácí), Markéta MACHÁLKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jan PREISLER (203 Česká republika, domácí) a Adam PRUŠKA (203 Česká republika, domácí).
Vydání Microscopy and Microanalysis, Cambridge University Press, 2019, 1431-9276.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 20602 Medical laboratory technology ;
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.414
Kód RIV RIV/00216224:14330/19:00110913
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Doi http://dx.doi.org/10.1017/S1431927619014983
UT WoS 000502313700003
Klíčová slova anglicky confocal microscopy; image registration; MALDI MS; mass spectrometry imaging; peeling
Štítky cbia-web, CF CELLIM
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 1. 2021 08:47.
Anotace
Spheroids—three-dimensional aggregates of cells grown from a cancer cell line—represent a model of living tissue for chemotherapy inves- tigation. Distribution of chemotherapeutics in spheroid sections was determined using the matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging (MALDI MSI). Proliferating or apoptotic cells were immunohistochemically labeled and visualized by laser scanning confocal fluorescence microscopy (LSCM). Drug efficacy was evaluated by comparing coregistered MALDI MSI and LSCM data of drug- treated spheroids with LSCM only data of untreated control spheroids. We developed a fiducial-based workflow for coregistration of low- resolution MALDI MS with high-resolution LSCM images. To allow comparison of drug and cell distribution between the drug-treated and untreated spheroids of different shapes or diameters, we introduced a common diffusion-related coordinate, the distance from the spheroid boundary. In a procedure referred to as “peeling”, we correlated average drug distribution at a certain distance with the average reduction in the affected cells between the untreated and the treated spheroids. This novel approach makes it possible to differentiate between peripheral cells that died due to therapy and the innermost cells which died naturally. Two novel algorithms—for MALDI MS image denoising and for weighting of MALDI MSI and LSCM data by the presence of cell nuclei—are also presented.
Návaznosti
EF16_013/0001775, projekt VaVNázev: Modernizace a podpora výzkumných aktivit národní infrastruktury pro biologické a medicínské zobrazování Czech-BioImaging
LM2015062, projekt VaVNázev: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
LTC17016, projekt VaVNázev: Benchmarking algoritmů segmentace a sledování buněk
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Benchmarking algoritmů segmentace a sledování buněk, INTER-COST
MUNI/A/1359/2018, interní kód MUNázev: Vývoj metod a instrumentace pro analýzu biologicky významných látek 2019
Investor: Masarykova univerzita, Vývoj metod a instrumentace pro analýzu biologicky významných látek 2019, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/G/0974/2016, interní kód MUNázev: Optimalizace cílené terapie kolorektálního karcinomu ovlivňováním účinnosti penetrace a cytotoxicity regulátorů buněčných signalizací
Investor: Masarykova univerzita, Optimalizace cílené terapie kolorektálního karcinomu ovlivňováním účinnosti penetrace a cytotoxicity regulátorů buněčných signalizací, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 26. 4. 2024 23:44