Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@proceedings{1574121,
author = {Bořilová Linhartová, Petra and Kala, Zdeněk and Lochman, Jan and Kunovský, Lumír and Dolina, Jiří and Grolich, Tomáš and Kroupa, Radek and Procházka, Vladimír and Slabý, Ondřej and Izakovičová Hollá, Lydie},
booktitle = {XXIII. Biologické dny 2019 - Moderní trendy biomedicínského výzkumu},
keywords = {microbioma; gastroesophageal reflux disease},
language = {cze},
isbn = {978-80-270-6488-5},
title = {Mikrobiom jícnu, žaludku a duodena u pacientů s gastroezofageální refluxní chorobou - pilotní studie},
url = {https://biologickedny2019.cz/wp-content/uploads/2019/09/Sbornik_Biologicke_dny_Brno.pdf},
year = {2019}
}
TY - CONF
ID - 1574121
AU - Bořilová Linhartová, Petra - Kala, Zdeněk - Lochman, Jan - Kunovský, Lumír - Dolina, Jiří - Grolich, Tomáš - Kroupa, Radek - Procházka, Vladimír - Slabý, Ondřej - Izakovičová Hollá, Lydie
PY - 2019
TI - Mikrobiom jícnu, žaludku a duodena u pacientů s gastroezofageální refluxní chorobou - pilotní studie
SN - 9788027064885
KW - microbioma
KW - gastroesophageal reflux disease
UR - https://biologickedny2019.cz/wp-content/uploads/2019/09/Sbornik_Biologicke_dny_Brno.pdf
L2 - https://biologickedny2019.cz/wp-content/uploads/2019/09/Sbornik_Biologicke_dny_Brno.pdf
N2 - Hostitelský mikrobiom může být důležitým faktorem v etiopatogenezi refluxní choroby jícnu (GERD), která významně zvyšuje riziko rozvoje ezofagitidy (RE), Barrettova jícnu (BE) a adenokarcinomu ezofagu (EAC). Cílem pilotní metagenomické studie bylo charakterizovat bakteriální biotu ve vzorcích z jícnu (normální, případně i patologické tkáně), žaludku (tělo a antrum) a dvanáctníku od pacientů s GERD a od zdravých kontrol. Z celkem 74 bioptických vzorků získaných při endoskopickém vyšetření 2 pacientů s RE, 4 s BE, 4 s EAC a 6 zdravých kontrol byla izolována nukleová kyselina použitím All Prep DNA/ RNA/miRNA Universal Kit (Qiagen). Produkty 16S rDNA PCR z oblasti V4 byly sekvenovány na platformě Illumina MiniSeq. Ve vzorcích bylo identifikováno celkem 20 kmenů, 86 řádů, 184 rodin a 295 bakteriálních rodů. Nejpočetnějšími kmeny ve všech vzorcích byly Proteobacteria 45 %, Firmicutes 39 %, Bacteroidetes 9 %, Actinobacteria 3 % a Fusobacteria 1 %. Ve vzorcích z jícnu dominovaly Streptococcus sp. a Prevotella sp. s nižším zastoupením Veillonella sp. Rozmanitost druhů lokálních společenstev (alfa diverzita) se mezi vzorky od pacientů s jednotlivými patologickými stavy/ zdravých kontrol významně nelišila (Shannonův index diverzity: 2,48 RE; 2,51 BE; 2,32 EAC a 2,52 zdravé kontroly), nicméně byla pozorována tendence snížené diverzity ve vzorcích od pacientů s EAC. Ve vzorcích z jícnu od pacientů s RE a BE byl patrný trend zvýšení gram-negativních taxonů (Fusobacterium, Campylobacter), zatímco ve skupině pacientů s EAC bylo pozorováno zvýšení taxonu Campylobacter a Lactobacillus (nemetrické multidimenzionální škálování). V návaznosti na pilotní data provedeme analýzu mikrobiomu horní části gastrointestinálního traktu za fyziologických a patologických podmínek u většího počtu pacientů s GERD. Poznání mikrobiomu a jeho případné diverzity v těchto lokalitách může přispět k časnější diagnostice a optimalizaci algoritmu sekundárně preventivních opatření při rozvoji a léčbě BE a EAC u pacientů s GERD.
ER -
BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Zdeněk KALA, Jan LOCHMAN, Lumír KUNOVSKÝ, Jiří DOLINA, Tomáš GROLICH, Radek KROUPA, Vladimír PROCHÁZKA, Ondřej SLABÝ and Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ. Mikrobiom jícnu, žaludku a duodena u pacientů s gastroezofageální refluxní chorobou - pilotní studie (Oesophageal, stomach and duodenum microbioma in patients with gastroesophageal reflux disease - a pilot study). In \textit{XXIII. Biologické dny 2019 - Moderní trendy biomedicínského výzkumu}. 2019. ISBN~978-80-270-6488-5.
|
