J 2019

CDK12 controls G1/S progression by regulating RNAPII processivity at core DNA replication genes

CHIRACKAL MANAVALAN, Anil Paul, Květa PILAŘOVÁ, Michael KLUGE, Koen BARTHOLOMEEUSEN, Michal RÁJECKÝ et. al.

Základní údaje

Originální název

CDK12 controls G1/S progression by regulating RNAPII processivity at core DNA replication genes

Autoři

CHIRACKAL MANAVALAN, Anil Paul (356 Indie, domácí), Květa PILAŘOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michael KLUGE (276 Německo), Koen BARTHOLOMEEUSEN (56 Belgie, domácí), Michal RÁJECKÝ (203 Česká republika, domácí), Jan OPPELT (203 Česká republika, domácí), PrashantKumar KHIRSARIYA (356 Indie, domácí), Kamil PARUCH (203 Česká republika, domácí), Lumír KREJČÍ (203 Česká republika, domácí), Caroline C FRIEDEL (276 Německo) a Dalibor BLAŽEK (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

EMBO reports, Hoboken, Wiley-Blackwell, 2019, 1469-221X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10400 1.4 Chemical sciences

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 7.497

Kód RIV

RIV/00216224:14740/19:00107754

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

UT WoS

000478503100001

Klíčová slova anglicky

CDK12; G1; S; CTD Ser2 phosphorylation; premature termination and polyadenylation; tandem duplications

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 13. 1. 2021 10:50, Mgr. Marie Šípková, DiS.

Anotace

V originále

CDK12 is a kinase associated with elongating RNA polymerase II (RNAPII) and is frequently mutated in cancer. CDK12 depletion reduces the expression of homologous recombination (HR) DNA repair genes, but comprehensive insight into its target genes and cellular processes is lacking. We use a chemical genetic approach to inhibit analog-sensitive CDK12, and find that CDK12 kinase activity is required for transcription of core DNA replication genes and thus for G1/S progression. RNA-seq and ChIP-seq reveal that CDK12 inhibition triggers an RNAPII processivity defect characterized by a loss of mapped reads from 3 ' ends of predominantly long, poly(A)-signal-rich genes. CDK12 inhibition does not globally reduce levels of RNAPII-Ser2 phosphorylation. However, individual CDK12-dependent genes show a shift of P-Ser2 peaks into the gene body approximately to the positions where RNAPII occupancy and transcription were lost. Thus, CDK12 catalytic activity represents a novel link between regulation of transcription and cell cycle progression. We propose that DNA replication and HR DNA repair defects as a consequence of CDK12 inactivation underlie the genome instability phenotype observed in many cancers.

Návaznosti

ED1.1.00/02.0068, projekt VaV
Název: CEITEC - central european institute of technology
EF17_050/0008496, projekt VaV
Název: MSCAfellow@MUNI
GA17-13692S, projekt VaV
Název: Charakterizace nové funkce pro cyklin dependentní kinázu 12 (Cdk12)
Investor: Grantová agentura ČR, Characterization of novel substrates and function for ovarian cancer-related cyclin-dependent kinase 12 (Cdk12)
GA17-17720S, projekt VaV
Název: Vnitřní vlastnosti RAD51 vlákna a jeho biologické regulace
Investor: Grantová agentura ČR, Vnitřní vlastnosti RAD51 vlákna a jeho biologické regulace
LM2015063, projekt VaV
Název: Národní infrastruktura chemické biologie (Akronym: CZ-­OPENSCREEN)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CZ-­OPENSCREEN: National Infrastructure for Chemical Biology
MUNI/A/1087/2018, interní kód MU
Název: Molekulární a buněčná biologie pro biomedicínské vědy
Investor: Masarykova univerzita, Molekulární a buněčná biologie pro biomedicínské vědy, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/E/0514/2019, interní kód MU
Název: CDK12 controls G1/S progression by regulating RNAPII processivity at core DNA replication genes
Investor: Masarykova univerzita, CDK12 controls G1/S progression by regulating RNAPII processivity at core DNA replication genes, Podpora zvýšení kvality vynikajících výsledků