2019
AtomicChargeCalculator II
RAČEK, Tomáš, Ondřej SCHINDLER, Vladimír HORSKÝ, Jaroslav KOČA, Dominik TOUŠEK et. al.Základní údaje
Originální název
AtomicChargeCalculator II
Autoři
RAČEK, Tomáš (203 Česká republika, domácí), Ondřej SCHINDLER (203 Česká republika, domácí), Vladimír HORSKÝ (203 Česká republika, domácí), Jaroslav KOČA (203 Česká republika, domácí), Dominik TOUŠEK (203 Česká republika, domácí) a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí)
Vydání
ELIXIR CZ Annual Conference 2019, 2019
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14740/19:00111276
Organizační jednotka
Středoevropský technologický institut
ISBN
978-80-86241-61-6
Klíčová slova anglicky
Partial atomic charge; AtomicChargeCalculator
Štítky
Změněno: 26. 3. 2020 16:50, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.
Anotace
V originále
Partial atomic charges are an important theoretical concept used in computational chemistry, cheminformatics, or structural biology. They cannot be measured; however, their values might be computed. Contrary to the time-consuming quantum-mechanical approaches, empirical methods provide a reasonably accurate and fast alternative. Unfortunately, many of these methods have no available implementation, and when they do, it is generally not user-friendly, nor accessible online. Based on the idea of the original AtomicChargeCalculator, its improved second version (ACC II) features another 16 empirical methods and dramatically simplifies the user interface to facilitate the process of setting up the whole computation. Integrating the LiteMol component, ACC II visualizes computed charges for both small and protein molecules. The application is freely available at http://ncbr.muni.cz/ACC_II.
Návaznosti
| LQ1601, projekt VaV |
|