J 2019

Directly Sequenced Genomes of Contemporary Strains of Syphilis Reveal Recombination-Driven Diversity in Genes Encoding Predicted Surface-Exposed Antigens

GRILLOVÁ, Linda, Jan OPPELT, Lenka MIKALOVÁ, Markéta NOVÁKOVÁ, LLorenzo GIACANI et. al.

Základní údaje

Originální název

Directly Sequenced Genomes of Contemporary Strains of Syphilis Reveal Recombination-Driven Diversity in Genes Encoding Predicted Surface-Exposed Antigens

Autoři

GRILLOVÁ, Linda (203 Česká republika, domácí), Jan OPPELT (203 Česká republika, domácí), Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Markéta NOVÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), LLorenzo GIACANI (840 Spojené státy), Anežka NIESNEROVÁ (203 Česká republika, domácí), Angel A. NODA (192 Kuba), Ariel E. MECHALY (250 Francie), Petra POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Darina CEJKOVA (203 Česká republika), Philippe A. GRANGE (250 Francie), Nicolas DUPIN (250 Francie), Radim STRNADEL (203 Česká republika), Marcus CHEN (36 Austrálie), Ian DENHAM (36 Austrálie), Natasha ARORA (756 Švýcarsko), Mathieu PICARDEAU (250 Francie), Christopher WESTON (840 Spojené státy), R. Allyn FORSYTH (840 Spojené státy) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Frontiers in Microbiology, Lausanne, Frontiers Media SA, 2019, 1664-302X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10606 Microbiology

Stát vydavatele

Švýcarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 4.236

Kód RIV

RIV/00216224:14110/19:00107834

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

UT WoS

000477999500001

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum subsp. pallidum; syphilis; direct whole genome sequencing; recombinationd-riven diversity; culture-independent bacterial enrichment

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 25. 10. 2024 13:28, Ing. Marie Švancarová

Anotace

V originále

Syphilis, caused by Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA), remains an important public health problem with an increasing worldwide prevalence. Despite recent advances in in vitro cultivation, genetic variability of this pathogen during infection is poorly understood. Here, we present contemporary and geographically diverse complete treponemal genome sequences isolated directly from patients using a methyl-directed enrichment prior to sequencing. This approach reveals that approximately 50% of the genetic diversity found in TPA is driven by inter- and/or intra-strain recombination events, particularly in strains belonging to one of the defined genetic groups of syphilis treponemes: Nichols-like strains. Recombinant loci were found to encode putative outer-membrane proteins and the recombination variability was almost exclusively found in regions predicted to be at the host-pathogen interface. Genetic recombination has been considered to be a rare event in treponemes, yet our study unexpectedly showed that it occurs at a significant level and may have important impacts in the biology of this pathogen, especially as these events occur primarily in the outer membrane proteins. This study reveals the existence of strains with different repertoires of surface-exposed antigens circulating in the current human population, which should be taken into account during syphilis vaccine development.

Návaznosti

GA17-25455S, projekt VaV
Název: Studium genomů patogenních treponem na základě analýzy jednotlivých buněk
Investor: Grantová agentura ČR, Studium genomů patogenních treponem na základě analýzy jednotlivých buněk
LM2015085, projekt VaV
Název: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud
MUNI/A/1087/2018, interní kód MU
Název: Molekulární a buněčná biologie pro biomedicínské vědy
Investor: Masarykova univerzita, Molekulární a buněčná biologie pro biomedicínské vědy, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
NV17-31333A, projekt VaV
Název: Vývoj nového typovacího systému pro původce syfilis, Treponema pallidum subsp. pallidum, zaměřeného na proteomické rozdíly
ROZV/24/LF/2018, interní kód MU
Název: LF - Příspěvek na IP 2108
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, LF - Příspěvek na IP 2108, Interní rozvojové projekty
90091, velká výzkumná infrastruktura
Název: NCMG