MANDÁKOVÁ, Terezie, Milan POUCH, J.R. BROCK, I.A. AL-SHEHBAZ a Martin LYSÁK. Origin and Evolution of Diploid and Allopolyploid Camelina Genomes Were Accompanied by Chromosome Shattering. Plant Cell. ROCKVILLE: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS, 2019, roč. 31, č. 11, s. 2596-2612. ISSN 1040-4651. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1105/tpc.19.00366.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Origin and Evolution of Diploid and Allopolyploid Camelina Genomes Were Accompanied by Chromosome Shattering
Autoři MANDÁKOVÁ, Terezie (203 Česká republika, domácí), Milan POUCH (203 Česká republika, domácí), J.R. BROCK (840 Spojené státy), I.A. AL-SHEHBAZ (840 Spojené státy) a Martin LYSÁK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Plant Cell, ROCKVILLE, AMER SOC PLANT BIOLOGISTS, 2019, 1040-4651.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10611 Plant sciences, botany
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 9.618
Kód RIV RIV/00216224:14740/19:00108120
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1105/tpc.19.00366
UT WoS 000504310900011
Klíčová slova anglicky BRASSICACEAE PHYLOGENY; ARABIDOPSIS-THALIANA; RECENT HYBRIDIZATION; FALSE FLAX; SATIVA; CONSEQUENCES; SEQUENCE; CHROMOTHRIPSIS; POLYPLOIDY; PLANTS
Štítky CF GEN, CF PLANT, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:47.
Anotace
Complexes of diploid and polyploid species have formed frequently during the evolution of land plants. In false flax (Camelina sativa), an important hexaploid oilseed crop closely related to Arabidopsis (Arabidopsis thaliana), the putative parental species as well as the origin of other Camelina species remained unknown. By using bacterial artificial chromosome-based chromosome painting, genomic in situ hybridization, and multi-gene phylogenetics, we aimed to elucidate the origin and evolution of the polyploid complex. Genomes of diploid camelinas (Camelina hispida, n = 7; Camelina laxa, n = 6; and Camelina neglecta, n = 6) originated from an ancestral n = 7 genome. The allotetraploid genome of Camelina rumelica (n = 13, (NH)-H-6) arose from hybridization between diploids related to C. neglecta (n = 6, N-6) and C. hispida (n = 7, H), and the N subgenome has undergone a substantial post-polyploid fractionation. The allohexaploid genomes of C. sativa and Camelina microcarpa (n = 20, (NNH)-N-6-H-7) originated through hybridization between an auto-allotetraploid C. neglecta-like genome (n = 13, (NN7)-N-6) and C. hispida (n = 7, H), and the three subgenomes have remained stable overall since the genome merger. Remarkably, the ancestral and diploid Camelina genomes were shaped by complex chromosomal rearrangements, resembling those associated with human disorders and resulting in the origin of genome-specific shattered chromosomes.
Návaznosti
GA17-13029S, projekt VaVNázev: Chybějící souvislosti: evoluce genomu v tribu Camelineae (brukvovité)
Investor: Grantová agentura ČR, Chybějící souvislosti: evoluce genomu v tribu Camelineae (brukvovité)
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 12. 5. 2024 23:10