NEVOLOVÁ, Šárka, Elisabet MAŇÁSKOVÁ, Stanislav MAZURENKO, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Development of Fluorescent Assay for Monitoring of Dehalogenase Activity. Biotechnology Journal. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2019, roč. 14, č. 3, s. 1-6. ISSN 1860-6768. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/biot.201800144.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Development of Fluorescent Assay for Monitoring of Dehalogenase Activity
Autoři NEVOLOVÁ, Šárka (203 Česká republika, domácí), Elisabet MAŇÁSKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Stanislav MAZURENKO (643 Rusko, domácí), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí) a Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí).
Vydání Biotechnology Journal, WEINHEIM, WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2019, 1860-6768.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.912
Kód RIV RIV/00216224:14310/19:00108192
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1002/biot.201800144
UT WoS 000460177400009
Klíčová slova anglicky activity screening; enzyme assay; fluorescence; haloalkane dehalogenase; sulfur mustard
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:46.
Anotace
The rapid accumulation of sequence data and powerful protein engineering techniques providing large mutant libraries have greatly heightened interest in efficient methods for biochemical characterization of proteins. Herein is reported a continuous assay for screening of enzymatic activity. The assay is developed and tested with the model enzymes haloalkane dehalogenases and relies upon a fluorescent change of a derivative of 8-hydroxypyrene-1,3,6-trisulphonic acid due to the pH drop associated with the dehalogenation reactions. The assay is performed in a microplate format using a purified enzyme, cell-free extract or intact cells, making the analysis quick and simple. The method exhibits high sensitivity with a limit of detection of 0.06 mM. The assay is successfully validated with gas chromatography and then applied for screening of 12 haloalkane dehalogenases with the environmental pollutant bis(2-chloroethyl) ether and chemical warfare agent sulfur mustard. Six enzymes exhibited detectable activity with both substrates. The within-day variability of the assay for five replicates (n = 5) was 21%.
Návaznosti
GA16-07965S, projekt VaVNázev: Řízená evoluce dynamických elementů v enzymech s využitím mikrofluidních čipů
Investor: Grantová agentura ČR, Řízená evoluce dynamických elementů v enzymech s využitím mikrofluidních čipů
LM2015051, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX RI)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumná infrastruktura RECETOX
LM2015055, projekt VaVNázev: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology
LO1214, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí
VytisknoutZobrazeno: 24. 8. 2024 02:59