CHRÁST, Lukáš, K. TRATSIAK, Joan PLANAS IGLESIAS, Lukáš DANIEL, T. PRUDNIKOVA, Jan BREZOVSKÝ, David BEDNÁŘ, I.K. SMATANOVA, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Deciphering the Structural Basis of High Thermostability of Dehalogenase from Psychrophilic Bacterium Marinobacter sp. ELB17. Microorganisms. Basel: MDPI, 2019, roč. 7, č. 11, s. 1-20. ISSN 2076-2607. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/microorganisms7110498.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Deciphering the Structural Basis of High Thermostability of Dehalogenase from Psychrophilic Bacterium Marinobacter sp. ELB17
Autoři CHRÁST, Lukáš (203 Česká republika, domácí), K. TRATSIAK, Joan PLANAS IGLESIAS (724 Španělsko, domácí), Lukáš DANIEL (203 Česká republika, domácí), T. PRUDNIKOVA, Jan BREZOVSKÝ (203 Česká republika, domácí), David BEDNÁŘ (203 Česká republika, domácí), I.K. SMATANOVA, Radka CHALOUPKOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Microorganisms, Basel, MDPI, 2019, 2076-2607.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10606 Microbiology
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.152
Kód RIV RIV/00216224:14310/19:00108215
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms7110498
UT WoS 000502273600021
Klíčová slova anglicky haloalkane dehalogenase; thermostability; psychrophile; access tunnel; dimer; catalytic pentad; enantiselectivity
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:39.
Anotace
Haloalkane dehalogenases are enzymes with a broad application potential in biocatalysis, bioremediation, biosensing and cell imaging. The new haloalkane dehalogenase DmxA originating from the psychrophilic bacterium Marinobacter sp. ELB17 surprisingly possesses the highest thermal stability (apparent melting temperature T-m,T-app = 65.9 degrees C) of all biochemically characterized wild type haloalkane dehalogenases belonging to subfamily II. The enzyme was successfully expressed and its crystal structure was solved at 1.45 angstrom resolution. DmxA structure contains several features distinct from known members of haloalkane dehalogenase family: (i) a unique composition of catalytic residues; (ii) a dimeric state mediated by a disulfide bridge; and (iii) narrow tunnels connecting the enzyme active site with the surrounding solvent. The importance of narrow tunnels in such paradoxically high stability of DmxA enzyme was confirmed by computational protein design and mutagenesis experiments.
Návaznosti
EF16_027/0008360, projekt VaVNázev: Postdoc@MUNI
GA17-24321S, projekt VaVNázev: Studium hydratace a flexibility enzymů pomocí pokročilých strukturních a biofyzikálních metod
Investor: Grantová agentura ČR, Studium hydratace a flexibility enzymů pomocí pokročilých strukturních a biofyzikálních metod
LM2015047, projekt VaVNázev: Česká národní infrastruktura pro biologická data (Akronym: ELIXIR-CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Česká národní infrastruktura pro biologická data
LM2015051, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX RI)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumná infrastruktura RECETOX
LM2015055, projekt VaVNázev: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology
LM2015085, projekt VaVNázev: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud
VytisknoutZobrazeno: 30. 7. 2024 07:35