Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Tomáš GROLICH, L. FIALA, Vladimír PROCHÁZKA, M. ŠKROVINA, Zdeněk KALA a Ondřej SLABÝ. Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta. Klinická onkologie. Ambit Media a.s., 2019, roč. 32, č. 2019, s. 157-159. ISSN 0862-495X.

Základní údaje

• Originální název: Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta
• Název anglicky: Utilization of next generation sequencing in analysis of circulating micrornas as predictive biomarkers for patients with locally advanced rectal Carcinoma
• Autoři: MACHÁČKOVÁ, Táňa (203 Česká republika, domácí), Tomáš GROLICH (203 Česká republika), L. FIALA, Vladimír PROCHÁZKA (203 Česká republika, domácí), M. ŠKROVINA, Zdeněk KALA (203 Česká republika, domácí) a Ondřej SLABÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: Klinická onkologie, Ambit Media a.s. 2019, 0862-495X.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 30204 Oncology
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/19:00108619
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• Klíčová slova anglicky: MicroRNAs; Neoplasms; CRC patients
• Štítky: rivok
• Příznaky: Recenzováno

Anotace

MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující RNA podílející se na posttranskripční regulaci genové exprese. Jsou esenciálními regulátory fyziologických procesů, podílejí se na patogenezi mnoha onemocnění a jejich deregulace byla prokázána u řady nádorových onemocnění vč. karcinomu rekta. Cirkulující miRNA přítomné v krevní plazmě by mohly být vhodnými kandidáty na neinvaziní prediktivní biomarkery odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta. Předkládaná pilotní studie se zabývá využitím sekvenování nové generace k analýze cirkulujících miRNA.

Anotace anglicky

MicroRNAs (miRNA) are short non-coding RNAs involved in post-transcriptional regulation of gene expression. MiRNAs are essential regulators of both physiological processes as of pathogeneses of many diseases, and their dysregulation was observed in many malignancies including rectal cancer. Circulating miRNAs presented in blood plasma could be potential candidates for non-invasive predictive bio markers of the response of patients with locally advanced rectal cancer to chemoradiotherapy. Presented study aims to evaluate the potential of next-generation sequencing in the analysis of circulating miRNAs. Material and methods: MiRNA expression profi les were done using samples of RNA isolated from blood plasma collected during TNM restaging and paired samples collected before initiation of neoadjuvant chemoradiotherapy. Sequencing libraries were prepared using kit which implements universal molecular indices that help to sensitively fi lter bio logical bias during data analysis. Sequencing data were processed by multidimensional bio statistical approaches. Conclusion: We identifi ed specific miRNA profi le enabling to distinguish the patients accordingly to their response to chemoradiotherapy.

Návaznosti

• NV16-31765A, projekt VaV: Název: Využití tkáňových/cirkulujících mikroRNA pro predikci léčebné odpovědi a zpřesnění restagingu karcinomu rekta po neoadjuvantní léčbě