KRAFČÍKOVÁ, Michaela, R. HANSEL-HERTSCH, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In Cell NMR Spectroscopy: Investigation of G-Quadruplex Structures Inside Living Xenopus laevis Oocytes. G-QUADRUPLEX NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS. TOTOWA: HUMANA PRESS INC, 2019, roč. 2035, č. 2019, s. 397-405. ISSN 1064-3745. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9666-7_25.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název In Cell NMR Spectroscopy: Investigation of G-Quadruplex Structures Inside Living Xenopus laevis Oocytes
Autoři KRAFČÍKOVÁ, Michaela (703 Slovensko, domácí), R. HANSEL-HERTSCH, Lukáš TRANTÍREK (203 Česká republika, garant, domácí) a Silvie TRANTÍRKOVÁ (203 Česká republika, domácí).
Vydání G-QUADRUPLEX NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS, TOTOWA, HUMANA PRESS INC, 2019, 1064-3745.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14740/19:00108250
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9666-7_25
UT WoS 000520558900026
Klíčová slova anglicky In-cell NMR; Xenopus laevis oocyte; DNA; RNA; G-quadruplex
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 6. 4. 2020 18:49.
Anotace
G-quadruplexes are inherently polymorphic nucleic acid structures. Their folding topology depends on the nucleic acid primary sequence and on physical-chemical environmental factors. Hence, it remains unclear if a G-quadruplex topology determined in the test tube (in vitro) will also form in vivo. Characterization of G-quadruplexes in their native environment has been proposed as an efficient strategy to tackle this issue. So far, characterization of G-quadruplex structures in living cells has relied exclusively on the use of Xenopus laevis oocytes as a eukaryotic cell model system. Here, we describe the protocol for the preparation of X. laevis oocytes for studies of G-quadruplexes as well as other nucleic acids motifs under native conditions using in-cell NMR spectroscopy.
Návaznosti
GA17-12075S, projekt VaVNázev: Polymorfní G-quadruplexy v promotorových oblastech genů
Investor: Grantová agentura ČR, Polymorfní G-quadruplexy v promotorových oblastech genů
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
653706, interní kód MUNázev: iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research (Akronym: iNEXT)
Investor: Evropská unie, iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research, RI Research Infrastructures (Excellent Science)
VytisknoutZobrazeno: 29. 7. 2024 00:23