In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells

J 2019

In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells

VÍŠKOVÁ, Pavlína, Daniel KRAFČÍK, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ

Základní údaje

Originální název

In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells

Autoři

VÍŠKOVÁ, Pavlína (203 Česká republika, domácí), Daniel KRAFČÍK (703 Slovensko, domácí), Lukáš TRANTÍREK (203 Česká republika, garant, domácí) a Silvie TRANTÍRKOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, United States, Wiley-Liss Inc, 2019, 1934-9270

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10609 Biochemical research methods

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14740/19:00108251

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

http://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71

Klíčová slova anglicky

DNA; eukaryotic cellin-cell NMR spectroscopy; mammalian cell

Štítky

rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 29. 4. 2020 11:46, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.

Anotace

V originále

In-cell NMR spectroscopy is a unique tool that enables the study of the structure and dynamics of biomolecules as well as their interactions in the complex environment of living cells at near-to-atomic resolution. In this article, detailed instructions are described for setting up an in-cell NMR experiment for monitoring structures of DNA oligonucleotides introduced into nuclei of living human cells via tailored electroporation. Detailed step-by-step protocols for both the preparation of an in-cell NMR sample as well as protocols for conducting essential control experiments including flow cytometry and confocal microscopy are described. The strengths and limitations of in-cell NMR experiments are discussed.

Návaznosti

GA16-10504S, projekt VaV

Název: Charakterizace struktury nukleových kyselin v komplexním prostředí živých buněk pomocí vysoce rozlišené NMR spektroskopie

Investor: Grantová agentura ČR, Charakterizace struktury nukleových kyselin v komplexním prostředí živých buněk pomocí vysoce rozlišené NMR spektroskopie

LQ1601, projekt VaV

Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020

653706, interní kód MU

Název: iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research (Akronym: iNEXT)

Investor: Evropská unie, iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research, RI Research Infrastructures (Excellent Science)

Citovat

VÍŠKOVÁ, Pavlína, Daniel KRAFČÍK, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells. Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. United States: Wiley-Liss Inc, 2019, roč. 76, č. 1, s. 1-14. ISSN 1934-9270. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71.

@article{1643298,
   author = {Víšková, Pavlína and Krafčík, Daniel and Trantírek, Lukáš and Trantírková, Silvie},
   article_location = {United States},
   article_number = {1},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71},
   keywords = {DNA; eukaryotic cellin-cell NMR spectroscopy; mammalian cell},
   language = {eng},
   issn = {1934-9270},
   journal = {Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry},
   title = {In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells},
   url = {https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/cpnc.71},
   volume = {76},
   year = {2019}
}

TY  - JOUR
ID  - 1643298
AU  - Víšková, Pavlína - Krafčík, Daniel - Trantírek, Lukáš - Trantírková, Silvie
PY  - 2019
TI  - In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells
JF  - Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry
VL  - 76
IS  - 1
SP  - 1-14
EP  - 1-14
PB  - Wiley-Liss Inc
SN  - 19349270
KW  - DNA
KW  - eukaryotic cellin-cell NMR spectroscopy
KW  - mammalian cell
UR  - https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/cpnc.71
L2  - https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/cpnc.71
N2  - In-cell NMR spectroscopy is a unique tool that enables the study of the structure and dynamics of biomolecules as well as their interactions in the complex environment of living cells at near-to-atomic resolution. In this article, detailed instructions are described for setting up an in-cell NMR experiment for monitoring structures of DNA oligonucleotides introduced into nuclei of living human cells via tailored electroporation. Detailed step-by-step protocols for both the preparation of an in-cell NMR sample as well as protocols for conducting essential control experiments including flow cytometry and confocal microscopy are described. The strengths and limitations of in-cell NMR experiments are discussed.
ER  -

VÍŠKOVÁ, Pavlína, Daniel KRAFČÍK, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells. \textit{Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry}. United States: Wiley-Liss Inc, 2019, roč.~76, č.~1, s.~1-14. ISSN~1934-9270. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71.

Podrobný výpis o publikaci