In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells

VÍŠKOVÁ, Pavlína, Daniel KRAFČÍK, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells. Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. United States: Wiley-Liss Inc, 2019, roč. 76, č. 1, s. 1-14. ISSN 1934-9270. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71.

Základní údaje

• Originální název: In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells
• Autoři: VÍŠKOVÁ, Pavlína (203 Česká republika, domácí), Daniel KRAFČÍK (703 Slovensko, domácí), Lukáš TRANTÍREK (203 Česká republika, garant, domácí) a Silvie TRANTÍRKOVÁ (203 Česká republika, domácí).
• Vydání: Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, United States, Wiley-Liss Inc, 2019, 1934-9270.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10609 Biochemical research methods
• Stát vydavatele: Spojené státy
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/19:00108251
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• Doi: http://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71
• Klíčová slova anglicky: DNA; eukaryotic cellin-cell NMR spectroscopy; mammalian cell
• Štítky: rivok
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

In-cell NMR spectroscopy is a unique tool that enables the study of the structure and dynamics of biomolecules as well as their interactions in the complex environment of living cells at near-to-atomic resolution. In this article, detailed instructions are described for setting up an in-cell NMR experiment for monitoring structures of DNA oligonucleotides introduced into nuclei of living human cells via tailored electroporation. Detailed step-by-step protocols for both the preparation of an in-cell NMR sample as well as protocols for conducting essential control experiments including flow cytometry and confocal microscopy are described. The strengths and limitations of in-cell NMR experiments are discussed.

Návaznosti

• GA16-10504S, projekt VaV: Název: Charakterizace struktury nukleových kyselin v komplexním prostředí živých buněk pomocí vysoce rozlišené NMR spektroskopie

Investor: Grantová agentura ČR, Charakterizace struktury nukleových kyselin v komplexním prostředí živých buněk pomocí vysoce rozlišené NMR spektroskopie

• LQ1601, projekt VaV: Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020

• 653706, interní kód MU: Název: iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research (Akronym: iNEXT)

Investor: Evropská unie, iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research, RI Research Infrastructures (Excellent Science)