J 2020

Laser capture microdissection in combination with mass spectrometry: Approach to characterization of tissue-specific proteomes of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Polyopisthocotylea)

ROUDNICKÝ, Pavel, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Milan GELNAR, Martin KAŠNÝ et. al.

Základní údaje

Originální název

Laser capture microdissection in combination with mass spectrometry: Approach to characterization of tissue-specific proteomes of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Polyopisthocotylea)

Autoři

ROUDNICKÝ, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), David POTĚŠIL (203 Česká republika, domácí), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, domácí), Milan GELNAR (203 Česká republika, domácí) a Martin KAŠNÝ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

PLOS ONE, San Francisco, Public Library of Science, 2020, 1932-6203

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10613 Zoology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 3.240

Kód RIV

RIV/00216224:14310/20:00114261

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

UT WoS

000542759600012

Klíčová slova anglicky

helminths; parasite; peptidase; inhibitor; laser microdissection; mass spectrometry

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 15. 10. 2024 09:24, Ing. Martina Blahová

Anotace

V originále

Eudiplozoon nipponicum (Goto, 1891) is a hematophagous monogenean ectoparasite which inhabits the gills of the common carp (Cyprinus carpio). Heavy infestation can lead to anemia and in conjunction with secondary bacterial infections cause poor health and eventual death of the host. This study is based on an innovative approach to protein localization which has never been used in parasitology before. Using laser capture microdissection, we dissected particular areas of the parasite body without contaminating the samples by surrounding tissue and in combination with analysis by mass spectrometry obtained tissue-specific proteomes of tegument, intestine, and parenchyma of our model organism, E. nipponicum. We successfully verified the presence of certain functional proteins (e.g. cathepsin L) in tissues where their presence was expected (intestine) and confirmed that there were no traces of these proteins in other tissues (tegument and parenchyma). Additionally, we identified a total of 2,059 proteins, including 72 peptidases and 33 peptidase inhibitors. As expected, the greatest variety was found in the intestine and the lowest variety in the parenchyma. Our results are significant on two levels. Firstly, we demonstrated that one can localize all proteins in one analysis and without using laboratory animals (antibodies for immunolocalization of single proteins). Secondly, this study offers the first complex proteomic data on not only the E. nipponicum but within the whole class of Monogenea, which was from this point of view until recently neglected.

Návaznosti

GAP506/12/1258, projekt VaV
Název: Interakce hostitel-parazit u krevsajících diplozoidních monogeneí: Výzkum vysoce specializovaných adaptací k parazitismu
Investor: Grantová agentura ČR, Interakce hostitel-parazit u krevsajících diplozoidních monogeneí: Výzkum vysoce specializovaných adaptací k parazitismu
GBP505/12/G112, projekt VaV
Název: ECIP - Evropské centrum ichtyoparazitologie
Investor: Grantová agentura ČR, ECIP - Evropské centrum ichtyoparazitologie
LM2018127, projekt VaV
Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LM2018140, projekt VaV
Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
LQ1601, projekt VaV
Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
MUNI/A/0918/2018, interní kód MU
Název: Studium evolučních a ekologických vztahů a procesů u akvatických bezobratlých živočichů a v hostitelsko-parazitických systémech (Akronym: EvolEcolParaHydro)
Investor: Masarykova univerzita, Studium evolučních a ekologických vztahů a procesů u akvatických bezobratlých živočichů a v hostitelsko-parazitických systémech, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
90127, velká výzkumná infrastruktura
Název: CIISB II
90132, velká výzkumná infrastruktura
Název: NCMG II