Structure of protein from neck of bacteriophage infecting Staphylococcus aureus

BŘENKOVÁ, Barbora, Marta ŠIBOROVÁ, Pavol BÁRDY, Roman PANTŮČEK a Pavel PLEVKA. Structure of protein from neck of bacteriophage infecting Staphylococcus aureus. In XV. Discussions in Structural Molecular Biology. 2018.

Základní údaje

• Originální název: Structure of protein from neck of bacteriophage infecting Staphylococcus aureus
• Název česky: Struktura proteinu krčku bakteriofága infikujícího Staphylococcus aureus
• Autoři: BŘENKOVÁ, Barbora, Marta ŠIBOROVÁ, Pavol BÁRDY, Roman PANTŮČEK a Pavel PLEVKA.
• Vydání: XV. Discussions in Structural Molecular Biology, 2018.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Prezentace na konferencích
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• Klíčová slova česky: S. aureus, konektor, rentgenová krystalografie
• Klíčová slova anglicky: S. aureus, connector, X-ray crystallography

Anotace

Bacteriophage phi812 is a lytic phage from the family Myoviridae. Phi812 infects most staphylococcal strains including those resistant to antibiotics. The structure of this bacteriophage was previously determined by cryo electron microscopy but functions of individual proteins remain unclear. Here we present our work towards resolving the structure of protein gp99 that forms the neck region of phi812. The protein may play a role in a regulation of the genome release from the virion during infection. Gp99 was cloned and expressed in E. coli and purified by affinity and size exclusion chromatography. A suitable crystallization condition was found and X-ray diffraction data with a resolution of 2.3 Å were collected. To solve the phase problem, a variety of methods had been tried, including molecular replacement, heavy atom soaking and co-crystallization, and seleno-methionine incorporation. The structure of gp99 will help explain the mechanism of bacterial infection by bacteriophage. As there is a rising number of antibiotic resistant bacterial strains causing severe illnesses, phage therapy has a high potential. For this purpose, detailed knowledge of bacteria-phage interactions is vital.

Anotace česky

Bakteriofág phi812 je lytický fág z čeledi Myoviridae. Phi812 je schopen infikovat většinu kmenů zlatého stafylokoka, včetně těch multirezistentních. Struktura tohoto bakteriofága byla dříve vyřešena pomocí kryo-elektronové mikroskopie, ale funkce jednotlivých proteinů jsou zatím nejasné. Tato práce ukazuje naši snahu o vyřešení struktury proteinu gp99, který tvoří oblast krčku bakteriofága. Tento protein může hrát roli při regulaci uvolňování genomu z virionu během infekce hostitelské buňky. Gen kódující gp99 byl klonován a exprimován v E. coli a protein byl purifikován afinitní chromatografií a gelovou filtrací. Po nalezení vhodné krystalizační podmínky byla nasbírána rentgenová difrakční data o rozlišení 2.3 Å. Několik metod bylo využito při řešení fázového problému - molekulární nahrazení, inkorporace selenomethioninu nebo těžkých atomů. Struktura proteinu gp99 pomůže vysvětlit mechanismus, kterým bakteriofágy infikují bakterie. Vzhledem k nárůstu počtu bakteriálních kmenů rezistentním k antibiotikům má fágová terapie vysoký klinický potenciál. Proto je důkladná znalost interakcí mezi bakteriofágy a jejich hostitelskými bakteriemi nezbytná.