PEŠKA, Vratislav, Martin MÁTL, Terezie MANDÁKOVÁ, Daniel VITALES, Petr FAJKUS, Jiří FAJKUS a Sonia GARCIA. Human-like telomeres in Zostera marina reveal a mode of transition from the plant to the human telomeric sequences. Journal of Experimental Botany. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 71, č. 19, s. 5786-5793. ISSN 0022-0957. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/jxb/eraa293.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Human-like telomeres in Zostera marina reveal a mode of transition from the plant to the human telomeric sequences
Autoři PEŠKA, Vratislav (garant), Martin MÁTL (203 Česká republika, domácí), Terezie MANDÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Daniel VITALES, Petr FAJKUS (203 Česká republika, domácí), Jiří FAJKUS (203 Česká republika, domácí) a Sonia GARCIA (724 Španělsko).
Vydání Journal of Experimental Botany, Oxford, Oxford University Press, 2020, 0022-0957.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10601 Cell biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 6.992
Kód RIV RIV/00216224:14740/20:00114533
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/jxb/eraa293
UT WoS 000577075400009
Klíčová slova anglicky Animal telomeres; chromosome; cytogenetics; plant telomeres; Tandem Repeats Finder; telomerase RNA; telomere template
Štítky CF GEN, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 3. 2021 15:05.
Anotace
A previous study describing the genome of Zostera marina, the most widespread seagrass in the Northern hemisphere, revealed some genomic signatures of adaptation to the aquatic environment such as the loss of stomatal genes, while other functions such as an algal-like cell wall composition were acquired. Beyond these, the genome structure and organization were comparable with those of the majority of plant genomes sequenced, except for one striking feature that went unnoticed at that time: the presence of human-like instead of the expected plant-type telomeric sequences. By using different experimental approaches including fluorescence in situ hybridization (FISH), genome skimming by next-generation sequencing (NGS), and analysis of non-coding transcriptome, we have confirmed its telomeric location in the chromosomes of Z. marina. We have also identified its telomerase RNA (TR) subunit, confirming the presence of the human-type telomeric sequence in the template region. Remarkably, this region was found to be very variable even in clades with a highly conserved telomeric sequence across their species. Based on this observation, we propose that alternative annealing preferences in the template borders can explain the transition between the plant and human telomeric sequences. The further identification of paralogues of TR in several plant genomes led us to the hypothesis that plants may retain an increased ability to change their telomeric sequence. We discuss the implications of this occurrence in the evolution of telomeres while introducing a mechanistic model for the transition from the plant to the human telomeric sequences.
Návaznosti
GA19-03442S, projekt VaVNázev: Geny pro ribozomální RNA - cestovatelé v čase a genomech
Investor: Grantová agentura ČR, Geny pro ribozomální RNA - cestovatelé v čase a genomech
GX20-01331X, projekt VaVNázev: Biogeneze a evoluce telomerázy u rostlin
Investor: Grantová agentura ČR, Biogenesis and evolution of telomerase in plants
LM2015091, projekt VaVNázev: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 21. 8. 2024 20:04