Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s
metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými
inhibitory

a 2020

Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory

BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL et. al.

Základní údaje

Originální název

Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory

Autoři

BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA a Alexandr POPRACH

Vydání

Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10. 2020

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

renální karcinom, sunitinib, rezistence, DIA proteomika, transgelin

Klíčová slova anglicky

renal cell carcinoma, sunitinib, resistance, DIA proteomics, transgelin

Změněno: 27. 1. 2021 16:26, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Anotace

V originále

Karcinom renálních buněk (RCC) reprezentuje asi 2-3% všech nádorů s více než 400 000 novými případy za rok s rostoucí incidencí, zvláště pak v České republice. Sunitinib, inhibitor tyrosin kinázy vaskulárního endotheliálního růstového faktoru (VEGF), je používán pro léčbu pacientů s metastatickým RCC (mRCC) v první linii s dobrou nebo střední prognózou. Zhruba třetina mRCC pacientů však na léčbu sunitinibem velmi špatně odpovídá. Cílem prezentované pilotní studie je nalézt proteiny spojené se špatnou terapeutickou odpovědí na sunitinib. V trénovacím souboru bylo analyzováno 8 vs. 8 mRCC nádorových tkání od pacientů odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem 3 měsíce po zahájení léčby a 16 přilehlých nenádorových tkání, pomocí LC-MS proteomiky v módu datově nezávislého sběru (DIA) dat na LC-MS systému Impact II (Bruker). Validační soubor obsahoval dalších 74 pacientů stratifikovaných dle odpovědi na léčbu a byl analyzován na systému QExactive HF-X (Thermo Fisher Scientific). Data byla analyzována v software Spectronaut (Biognosys). V analýze trénovacího souboru bylo v primárních nádorech odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem deregulováno 42 proteinových skupin (q<0.01). Analýza drah odhalila obohacené dráhy elastických vláken, vesikulárního transportu a transportu malých molekul. Na základě uvedených analýz byl pro funkční analýzy vybrán transgelin protein zapojený do remodelace aktinového cytoskeletu. U TAGLN genu byl úspěšně proveden “knockout“ metodou CRISPR/Cas9. Buňky s umlčeným transgelinem neproliferovaly, buňky s částečně umlčeným transgelinem vykazovaly významně horší proliferaci a přežití ve srovnání s mateřskou linií. Vztah k léčebné odpovědi byl následně potvrzen také na nezávislém validačním souboru pacientů. Data ukazují, že transgelin podporuje přežití RCC buněk a zřejmě přispívá k jejich přirozené rezistenci k sunitinibu.

Návaznosti

LM2018127, projekt VaV

Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology

MUNI/A/1252/2019, interní kód MU

Název: Podpora biochemického výzkumu v roce 2020

Investor: Masarykova univerzita, Podpora biochemického výzkumu v roce 2020, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

NV19-08-00250, projekt VaV

Název: Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi

Citovat

BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA a Alexandr POPRACH. Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory. In Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10. 2020.

@proceedings{1731064,
   author = {Bouchal, Pavel and Bouchalová, Pavla and Beránek, Jindřich and Lapčík, Petr and Potěšil, David and Podhorec, Ján and Fiala, Ondřej and Poprach, Alexandr},
   booktitle = {Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10.},
   keywords = {renal cell carcinoma, sunitinib, resistance, DIA proteomics, transgelin},
   language = {cze},
   title = {Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory},
   url = {https://czproteo.cz/patek-27-listopadu-2020-online/},
   year = {2020}
}

TY  - CONF
ID  - 1731064
AU  - Bouchal, Pavel - Bouchalová, Pavla - Beránek, Jindřich - Lapčík, Petr - Potěšil, David - Podhorec, Ján - Fiala, Ondřej - Poprach, Alexandr
PY  - 2020
TI  - Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory
KW  - renal cell carcinoma, sunitinib, resistance, DIA proteomics, transgelin
UR  - https://czproteo.cz/patek-27-listopadu-2020-online/
N2  - Karcinom renálních buněk (RCC) reprezentuje asi 2-3% všech nádorů s více než 400 000 novými případy za rok s rostoucí incidencí, zvláště pak v České republice. Sunitinib, inhibitor tyrosin kinázy vaskulárního endotheliálního růstového faktoru (VEGF), je používán pro léčbu pacientů s metastatickým RCC (mRCC) v první linii s dobrou nebo střední prognózou. Zhruba třetina mRCC pacientů však na léčbu sunitinibem velmi špatně odpovídá. Cílem prezentované pilotní studie je nalézt proteiny spojené se špatnou terapeutickou odpovědí na sunitinib. V trénovacím souboru bylo analyzováno 8 vs. 8 mRCC nádorových tkání od pacientů odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem 3 měsíce po zahájení léčby a 16 přilehlých nenádorových tkání, pomocí LC-MS proteomiky v módu datově nezávislého sběru (DIA) dat na LC-MS systému Impact II (Bruker). Validační soubor obsahoval dalších 74 pacientů stratifikovaných dle odpovědi na léčbu a byl analyzován na systému QExactive HF-X (Thermo Fisher Scientific). Data byla analyzována v software Spectronaut (Biognosys). V analýze trénovacího souboru bylo v primárních nádorech odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem deregulováno 42 proteinových skupin (q<0.01). Analýza drah odhalila obohacené dráhy elastických vláken, vesikulárního transportu a transportu malých molekul. Na základě uvedených analýz byl pro funkční analýzy vybrán transgelin protein zapojený do remodelace aktinového cytoskeletu. U TAGLN genu byl úspěšně proveden “knockout“ metodou CRISPR/Cas9. Buňky s umlčeným transgelinem neproliferovaly, buňky s částečně umlčeným transgelinem vykazovaly významně horší proliferaci a přežití ve srovnání s mateřskou linií. Vztah k léčebné odpovědi byl následně potvrzen také na nezávislém validačním souboru pacientů. Data ukazují, že transgelin podporuje přežití RCC buněk a zřejmě přispívá k jejich přirozené rezistenci k sunitinibu.
ER  -

BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA a Alexandr POPRACH. Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory. In \textit{Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10.}. 2020.

Podrobný výpis o publikaci