BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA a Alexandr POPRACH. Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory. In Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10. 2020.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory
Autoři BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA a Alexandr POPRACH.
Vydání Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10. 2020.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky renální karcinom, sunitinib, rezistence, DIA proteomika, transgelin
Klíčová slova anglicky renal cell carcinoma, sunitinib, resistance, DIA proteomics, transgelin
Změnil Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 27. 1. 2021 16:26.
Anotace
Karcinom renálních buněk (RCC) reprezentuje asi 2-3% všech nádorů s více než 400 000 novými případy za rok s rostoucí incidencí, zvláště pak v České republice. Sunitinib, inhibitor tyrosin kinázy vaskulárního endotheliálního růstového faktoru (VEGF), je používán pro léčbu pacientů s metastatickým RCC (mRCC) v první linii s dobrou nebo střední prognózou. Zhruba třetina mRCC pacientů však na léčbu sunitinibem velmi špatně odpovídá. Cílem prezentované pilotní studie je nalézt proteiny spojené se špatnou terapeutickou odpovědí na sunitinib. V trénovacím souboru bylo analyzováno 8 vs. 8 mRCC nádorových tkání od pacientů odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem 3 měsíce po zahájení léčby a 16 přilehlých nenádorových tkání, pomocí LC-MS proteomiky v módu datově nezávislého sběru (DIA) dat na LC-MS systému Impact II (Bruker). Validační soubor obsahoval dalších 74 pacientů stratifikovaných dle odpovědi na léčbu a byl analyzován na systému QExactive HF-X (Thermo Fisher Scientific). Data byla analyzována v software Spectronaut (Biognosys). V analýze trénovacího souboru bylo v primárních nádorech odpovídajících vs. neodpovídajících na léčbu sunitinibem deregulováno 42 proteinových skupin (q<0.01). Analýza drah odhalila obohacené dráhy elastických vláken, vesikulárního transportu a transportu malých molekul. Na základě uvedených analýz byl pro funkční analýzy vybrán transgelin protein zapojený do remodelace aktinového cytoskeletu. U TAGLN genu byl úspěšně proveden “knockout“ metodou CRISPR/Cas9. Buňky s umlčeným transgelinem neproliferovaly, buňky s částečně umlčeným transgelinem vykazovaly významně horší proliferaci a přežití ve srovnání s mateřskou linií. Vztah k léčebné odpovědi byl následně potvrzen také na nezávislém validačním souboru pacientů. Data ukazují, že transgelin podporuje přežití RCC buněk a zřejmě přispívá k jejich přirozené rezistenci k sunitinibu.
Návaznosti
LM2018127, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
MUNI/A/1252/2019, interní kód MUNázev: Podpora biochemického výzkumu v roce 2020
Investor: Masarykova univerzita, Podpora biochemického výzkumu v roce 2020, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
NV19-08-00250, projekt VaVNázev: Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
VytisknoutZobrazeno: 23. 7. 2024 17:40