ROITHOVA, A., Zuzana FEKETOVÁ, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a D. STANEK. DIS3L2 and LSm proteins are involved in the surveillance of Sm ring-deficient snRNAs. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, č. 11, s. 6184-6197. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa301.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název DIS3L2 and LSm proteins are involved in the surveillance of Sm ring-deficient snRNAs
Autoři ROITHOVA, A., Zuzana FEKETOVÁ (703 Slovensko, domácí), Štěpánka VAŇÁČOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí) a D. STANEK.
Vydání Nucleic acids research, Oxford, Oxford University Press, 2020, 0305-1048.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 16.971
Kód RIV RIV/00216224:14740/20:00114751
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa301
UT WoS 000574284500034
Klíčová slova anglicky MESSENGER-RNA; DEGRADATION PATHWAY; NONCODING RNAS; TRANSLATION FACTORS; STRUCTURAL BASIS; TRUNCATED FORMS; QUALITY-CONTROL; CAJAL BODIES; CORE DOMAIN; COMPLEX
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2021 12:30.
Anotace
Spliceosomal small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs) undergo a complex maturation pathway containing multiple steps in the nucleus and in the cytoplasm. snRNP biogenesis is strictly proof-read and several quality control checkpoints are placed along the pathway. Here, we analyzed the fate of small nuclear RNAs (snRNAs) that are unable to acquire a ring of Sm proteins. We showed that snRNAs lacking the Sm ring are unstable and accumulate in P-bodies in an LSm1-dependent manner. We further provide evidence that defective snRNAs without the Sm binding site are uridylated at the 3' end and associate with DIS3L2 3'-> 5' exoribonuclease and LSm proteins. Finally, inhibition of 5'-> 3' exoribonuclease XRN1 increases association of Delta Sm snRNAs with DIS3L2, which indicates competition and compensation between these two degradation enzymes. Together, we provide evidence that defective snRNAs without the Sm ring are uridylated and degraded by alternative pathways involving either DIS3L2 or LSm proteins and XRN1.
Návaznosti
GA16-21341S, projekt VaVNázev: Studium úlohy uridylace RNA v lidských buňkách
Investor: Grantová agentura ČR, Studium úlohy uridylace RNA v lidských buňkách
GA20-19617S, projekt VaVNázev: Molekulární mechanismy nekanonických 3' terminálních modifikací RNA a jejich úloha v metabolismu kódujících a nekódujících RNA
Investor: Grantová agentura ČR, The molecular mechanisms of noncanonical 3' terminal RNA tailing and its role in the metabolism of coding and noncoding RNAs
LM2015062, projekt VaVNázev: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 31. 7. 2024 23:14