Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3

JURÁSEK, Miroslav, Jitender KUMAR, Petra PACLÍKOVÁ, Alka Kumari JADAUN, Konstantinos TRIPSIANES, Vítězslav BRYJA a Robert VÁCHA. Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3. Scientific Reports. NATURE PUBLISHING GROUP, 2021, roč. 11, č. 1, s. "1484", 14 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-79398-5.

Základní údaje

Originální název

Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3

Autoři

JURÁSEK, Miroslav (203 Česká republika, domácí), Jitender KUMAR (356 Indie, domácí), Petra PACLÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Alka Kumari JADAUN (356 Indie, domácí), Konstantinos TRIPSIANES (300 Řecko, domácí), Vítězslav BRYJA (203 Česká republika, domácí) a Robert VÁCHA (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Scientific Reports, NATURE PUBLISHING GROUP, 2021, 2045-2322

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 4.996

Kód RIV

RIV/00216224:14740/21:00118888

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-79398-5

UT WoS

000609782400005

Klíčová slova anglicky

HUMAN PHOSPHATASE HPTP1E; PARTICLE MESH EWALD; PROTEIN INTERACTIONS; LIGAND RECOGNITION; PAR-6 PDZ; BINDING; DYNAMICS; REVEALS; COMPLEX; MODES

Štítky

CF BIC, CF NMR, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

The PDZ domain of Dishevelled 3 protein belongs to a highly abundant protein recognition motif which typically binds short C-terminal peptides. The affinity of the PDZ towards the peptides could be fine-tuned by a variety of post-translation modifications including phosphorylation. However, how phosphorylations affect the PDZ structure and its interactions with ligands remains elusive. Combining molecular dynamics simulations, NMR titration, and biological experiments, we explored the role of previously reported phosphorylation sites and their mimetics in the Dishevelled PDZ domain. Our observations suggest three major roles for phosphorylations: (1) acting as an on/off PDZ binding switch, (2) allosterically affecting the binding groove, and (3) influencing the secondary binding site. Our simulations indicated that mimetics had similar but weaker effects, and the effects of distinct sites were non-additive. This study provides insight into the Dishevelled regulation by PDZ phosphorylation. Furthermore, the observed effects could be used to elucidate the regulation mechanisms in other PDZ domains.

---

Návaznosti

GA17-11571S, projekt VaV	Název: Amfifilní peptidy na fosfolipidových membránách Investor: Grantová agentura ČR, Amphiphilic Peptides at Phospholipid Membranes
GA18-17658S, projekt VaV	Název: Odhalení tajemství signální dráhy WNT analýzou struktury proteinu Dishevelled Investor: Grantová agentura ČR, Odhalení tajemství signální dráhy WNT analýzou struktury proteinu Dishevelled
LM2015043, projekt VaV	Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LM2015085, projekt VaV	Název: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud
LM2018127, projekt VaV	Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LQ1601, projekt VaV	Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
MUNI/G/0739/2017, interní kód MU	Název: Pushing the limits in automated NMR structure determination using a single 4D NOESY spectrum and machine learning methods Investor: Masarykova univerzita, Pushing the limits in automated NMR structure determination using a single 4D NOESY spectrum and machine learning methods, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
MUNI/G/1100/2016, interní kód MU	Název: Computational chemistry for Wnt signaling pathway Investor: Masarykova univerzita, Computational chemistry for Wnt signaling pathway, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
90042, velká výzkumná infrastruktura	Název: CESNET II
90043, velká výzkumná infrastruktura	Název: CIISB
90070, velká výzkumná infrastruktura	Název: IT4Innovations
90127, velká výzkumná infrastruktura	Název: CIISB II