JURÁSEK, Miroslav, Jitender KUMAR, Petra PACLÍKOVÁ, Alka Kumari JADAUN, Konstantinos TRIPSIANES, Vítězslav BRYJA a Robert VÁCHA. Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3. Scientific Reports. NATURE PUBLISHING GROUP, 2021, roč. 11, č. 1, s. "1484", 14 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-79398-5.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3
Autoři JURÁSEK, Miroslav (203 Česká republika, domácí), Jitender KUMAR (356 Indie, domácí), Petra PACLÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Alka Kumari JADAUN (356 Indie, domácí), Konstantinos TRIPSIANES (300 Řecko, domácí), Vítězslav BRYJA (203 Česká republika, domácí) a Robert VÁCHA (203 Česká republika, domácí).
Vydání Scientific Reports, NATURE PUBLISHING GROUP, 2021, 2045-2322.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.996
Kód RIV RIV/00216224:14740/21:00118888
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-79398-5
UT WoS 000609782400005
Klíčová slova anglicky HUMAN PHOSPHATASE HPTP1E; PARTICLE MESH EWALD; PROTEIN INTERACTIONS; LIGAND RECOGNITION; PAR-6 PDZ; BINDING; DYNAMICS; REVEALS; COMPLEX; MODES
Štítky CF BIC, CF NMR, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 2. 2023 08:18.
Anotace
The PDZ domain of Dishevelled 3 protein belongs to a highly abundant protein recognition motif which typically binds short C-terminal peptides. The affinity of the PDZ towards the peptides could be fine-tuned by a variety of post-translation modifications including phosphorylation. However, how phosphorylations affect the PDZ structure and its interactions with ligands remains elusive. Combining molecular dynamics simulations, NMR titration, and biological experiments, we explored the role of previously reported phosphorylation sites and their mimetics in the Dishevelled PDZ domain. Our observations suggest three major roles for phosphorylations: (1) acting as an on/off PDZ binding switch, (2) allosterically affecting the binding groove, and (3) influencing the secondary binding site. Our simulations indicated that mimetics had similar but weaker effects, and the effects of distinct sites were non-additive. This study provides insight into the Dishevelled regulation by PDZ phosphorylation. Furthermore, the observed effects could be used to elucidate the regulation mechanisms in other PDZ domains.
Návaznosti
GA17-11571S, projekt VaVNázev: Amfifilní peptidy na fosfolipidových membránách
Investor: Grantová agentura ČR, Amphiphilic Peptides at Phospholipid Membranes
GA18-17658S, projekt VaVNázev: Odhalení tajemství signální dráhy WNT analýzou struktury proteinu Dishevelled
Investor: Grantová agentura ČR, Odhalení tajemství signální dráhy WNT analýzou struktury proteinu Dishevelled
LM2015043, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LM2015085, projekt VaVNázev: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud
LM2018127, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
MUNI/G/0739/2017, interní kód MUNázev: Pushing the limits in automated NMR structure determination using a single 4D NOESY spectrum and machine learning methods
Investor: Masarykova univerzita, Pushing the limits in automated NMR structure determination using a single 4D NOESY spectrum and machine learning methods, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
MUNI/G/1100/2016, interní kód MUNázev: Computational chemistry for Wnt signaling pathway
Investor: Masarykova univerzita, Computational chemistry for Wnt signaling pathway, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
90042, velká výzkumná infrastrukturaNázev: CESNET II
90070, velká výzkumná infrastrukturaNázev: IT4Innovations
VytisknoutZobrazeno: 24. 7. 2024 04:24