Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic
myeloid leukemia patients in deep molecular response and
sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

J 2021

Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

SMITALOVÁ, Dagmar, D. DVORAKOVA, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ

Základní údaje

Originální název

Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

Autoři

SMITALOVÁ, Dagmar (203 Česká republika, domácí), D. DVORAKOVA, Zdeněk RÁČIL (203 Česká republika) a Marianna ROMŽOVÁ (703 Slovensko, domácí)

Vydání

Practical Laboratory Medicine, AMSTERDAM, ELSEVIER, 2021, 2352-5517

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30204 Oncology

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14740/21:00120108

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

http://dx.doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210

UT WoS

000653682600011

Klíčová slova anglicky

Chronic myeloid leukemia; BCR-ABL1 monitoring; GeneXpert BCR-ABL Monitor assay; RT-qPCR; Digital PCR

Štítky

14110212, podil, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 14. 7. 2021 10:41, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.

Anotace

V originále

BCR-ABL1 molecular detection using quantitative PCR (qPCR) methods is the golden standard of chronic myeloid leukemia (CML) monitoring. However, due to variable sensitivity of qPCR assays across laboratories, alternative methods are tested. Digital PCR (dPCR) has been suggested as a robust and reproducible option. Here we present a comparison of droplet dPCR with routinely used reverse-transcription qPCR (RT-qPCR) and automated GeneXpert systems. Detection limit of dPCR was above 3 BCR-ABL1 copies, although due to background amplification the resulting sensitivity was 0.01% BCR-ABL1 (MR4.0). Nevertheless, in comparison with GeneXpert, dPCR categorized more than 50% of the patients into different MR groups, showing a potential for improved BCR-ABL1 detection.

Návaznosti

MUNI/A/1105/2018, interní kód MU

Název: Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VI (Akronym: VýDiTeHeMA VI)

Investor: Masarykova univerzita, Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VI, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

MUNI/A/1395/2019, interní kód MU

Název: Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VII (Akronym: VýDiTeHeMa VII)

Investor: Masarykova univerzita, Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VII, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

NV17-30397A, projekt VaV

Název: Mutační analýza primitivních buněčných populací u chronické myeloidní leukémie: za hranicí BCR-ABL1

Citovat

SMITALOVÁ, Dagmar, D. DVORAKOVA, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ. Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays. Practical Laboratory Medicine. AMSTERDAM: ELSEVIER, 2021, roč. 25, MAY, s. nestrankovano, 6 s. ISSN 2352-5517. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210.

@article{1782161,
   author = {Smitalová, Dagmar and Dvorakova, D. and Ráčil, Zdeněk and Romžová, Marianna},
   article_location = {AMSTERDAM},
   article_number = {MAY},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210},
   keywords = {Chronic myeloid leukemia; BCR-ABL1 monitoring; GeneXpert BCR-ABL Monitor assay; RT-qPCR; Digital PCR},
   language = {eng},
   issn = {2352-5517},
   journal = {Practical Laboratory Medicine},
   title = {Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays},
   url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235255172100010X?via%3Dihub},
   volume = {25},
   year = {2021}
}

TY  - JOUR
ID  - 1782161
AU  - Smitalová, Dagmar - Dvorakova, D. - Ráčil, Zdeněk - Romžová, Marianna
PY  - 2021
TI  - Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays
JF  - Practical Laboratory Medicine
VL  - 25
IS  - MAY
SP  - nestrankovano
EP  - nestrankovano
PB  - ELSEVIER
SN  - 23525517
KW  - Chronic myeloid leukemia
KW  - BCR-ABL1 monitoring
KW  - GeneXpert BCR-ABL Monitor assay
KW  - RT-qPCR
KW  - Digital PCR
UR  - https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235255172100010X?via%3Dihub
N2  - BCR-ABL1 molecular detection using quantitative PCR (qPCR) methods is the golden standard of chronic myeloid leukemia (CML) monitoring. However, due to variable sensitivity of qPCR assays across laboratories, alternative methods are tested. Digital PCR (dPCR) has been suggested as a robust and reproducible option. Here we present a comparison of droplet dPCR with routinely used reverse-transcription qPCR (RT-qPCR) and automated GeneXpert systems. Detection limit of dPCR was above 3 BCR-ABL1 copies, although due to background amplification the resulting sensitivity was 0.01% BCR-ABL1 (MR4.0). Nevertheless, in comparison with GeneXpert, dPCR categorized more than 50% of the patients into different MR groups, showing a potential for improved BCR-ABL1 detection.
ER  -

SMITALOVÁ, Dagmar, D. DVORAKOVA, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ. Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays. \textit{Practical Laboratory Medicine}. AMSTERDAM: ELSEVIER, 2021, roč.~25, MAY, s.~nestrankovano, 6 s. ISSN~2352-5517. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210.

Podrobný výpis o publikaci