BERA, Krishnendu, Suchismita SUBADINI, Jozef HRITZ a Harekrushna SAHOO. Perturbing the unfolding of CRABP I using polyethylene glycol: An experimental and theoretical study. Online. In 13th EBSA congress, July 24–28, 2021, Vienna, Austria. European Biophysics Journal, Springer Nature, 2021, s. 1–226. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00249-021-01558-w.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Perturbing the unfolding of CRABP I using polyethylene glycol: An experimental and theoretical study
Autoři BERA, Krishnendu, Suchismita SUBADINI, Jozef HRITZ a Harekrushna SAHOO.
Vydání 13th EBSA congress, July 24–28, 2021, Vienna, Austria, od s. 1–226, 2021.
Nakladatel European Biophysics Journal, Springer Nature
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání elektronická verze "online"
WWW URL
Doi http://dx.doi.org/10.1007/s00249-021-01558-w
Příznaky Mezinárodní význam
Změnil Změnil: Krishnendu Bera, Ph.D., učo 490519. Změněno: 30. 9. 2021 00:34.
Anotace
Proteins significantly affected by crowding nature of macromolecules. Thus, it is pertinent to investigate the role of crowding environment on the denaturation and renaturation kinetics of protein. Different molecular weights of Polyethylene glycol (PEG) have been considered as a molecular crowders and CRABP I (cellular retinoic acid binding protein I),as a model protein in this study. The secondary structure analysis was performed by circular dichroism (CD) spectroscopy and the unfolding kinetics using intrinsic fluorescence of CRABP I at 37o C to mimic the in vivo condition. Both PEG 2000 and PEG 4000 act as stabilizers by hamstring the unfolding kinetic rates. The unfolding kinetic slopes were different for both PEG, which indicating PEG favour compact conformations of protein as a function of concentration and molecular weight. The molecular dynamics(MD) studies revealed that PEG 2000 molecules assembled together during the 500 ns simulation, which is increasing the stability and percentage of β-sheet of the protein. The experimental findings were well supported by the theoretical results.
Návaznosti
GF15-34684L, projekt VaVNázev: Efektivní výpočty volných energií a konfiguračního vzorkování protein-­‐proteinových interakcí
Investor: Grantová agentura ČR, Efektivní výpočty volných energií a konfiguračního vzorkování protein-proteinových interakcí
LM2018140, velká výzkumná infrastrukturaNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
VytisknoutZobrazeno: 7. 5. 2024 20:39