J 2021

Universal two-point interaction of mediator KIX with 9aaTAD activation domains

HOFROVÁ, Alena, Petr LOUŠA, Monika KUBÍČKOVÁ, Jozef HRITZ, Tomáš OTAŠEVIČ et. al.

Základní údaje

Originální název

Universal two-point interaction of mediator KIX with 9aaTAD activation domains

Autoři

HOFROVÁ, Alena (203 Česká republika, domácí), Petr LOUŠA (203 Česká republika, domácí), Monika KUBÍČKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jozef HRITZ (703 Slovensko, domácí), Tomáš OTAŠEVIČ (203 Česká republika, domácí), Martin REPKO (203 Česká republika, domácí), Andrea KNIGHT (203 Česká republika, domácí) a Martin PISKÁČEK (40 Rakousko, domácí)

Vydání

Journal of cellular biochemistry, Hoboken (USA), WILEY-BLACKWELL, 2021, 0730-2312

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 4.480

Kód RIV

RIV/00216224:14110/21:00120140

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

UT WoS

000669605600001

Klíčová slova anglicky

9aaTAD; activation domain; E2A; KIX; MLL; p53

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 27. 10. 2024 15:14, Ing. Martina Blahová

Anotace

V originále

The nine-amino-acid activation domain (9aaTAD) is defined by a short amino acid pattern including two hydrophobic regions (positions p3-4 and p6-7). The KIX domain of mediator transcription CBP interacts with the 9aaTAD domains of transcription factors MLL, E2A, NF-kB, and p53. In this study, we analyzed the 9aaTADs-KIX interactions by nuclear magnetic resonance. The positions of three KIX helixes alpha 1-alpha 2-alpha 3 are influenced by sterically-associated hydrophobic I611, L628, and I660 residues that are exposed to solvent. The positions of two rigid KIX helixes alpha 1 and alpha 2 generate conditions for structural folding in the flexible KIX-L12-G2 regions localized between them. The three KIX I611, L628, and I660 residues interact with two 9aaTAD hydrophobic residues in positions p3 and p4 and together build a hydrophobic core of five residues (5R). Numerous residues in 9aaTAD position p3 and p4 could provide this interaction. Following binding of the 9aaTAD to KIX, the hydrophobic I611, L628, and I660 residues are no longer exposed to solvent and their position changes inside the hydrophobic core together with position of KIX alpha 1-alpha 2-alpha 3 helixes. The new positions of the KIX helixes alpha 1 and alpha 2 allow the KIX-L12-G2 enhanced formation. The second hydrophobic region of the 9aaTAD (positions p6 and p7) provides strong binding with the KIX-L12-G2 region. Similarly, multiple residues in 9aaTAD position p6 and p7 could provide this interaction. In conclusion, both 9aaTAD regions p3, p4 and p6, p7 provide co-operative and highly universal binding to mediator KIX. The hydrophobic core 5R formation allows new positions of the rigid KIX alpha-helixes and enables the enhanced formation of the KIX-L12-G2 region. This contributes to free energy and is the key for the KIX-9aaTAD binding. Therefore, the 9aaTAD-KIX interactions do not operate under the rigid key-and-lock mechanism what explains the 9aaTAD natural variability.

Návaznosti

LTAUSA18168, projekt VaV
Název: Selektivní NMR značení jako nástroj pro charakterizaci proteinových komplexů zapojených do neurodegenerativních onemocnění
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Selektivní NMR značení jako nástroj pro charakterizaci proteinových komplexů zapojených do neurodegenerativních onemocnění, INTER-ACTION
NV19-05-00410, projekt VaV
Název: Úloha cytotoxických gamma-delta T buněk na terapeutické rezistenci a recidivě Glioblastoma Multiforme
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Úloha cytotoxických gamma-delta T buněk na terapeutické rezistenci a recidivě Glioblastoma Multiforme
90127, velká výzkumná infrastruktura
Název: CIISB II