a 2021

ČERNÝ FOSFOR PRO CITLIVÉ KLINICKÉ APLIKACE V HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRII BIOMOLEKUL

MANDAL, Govinda, Lukáš PEČINKA, Lukáš MORÁŇ, Petr VAŇHARA, Josef HAVEL et. al.

Základní údaje

Originální název

ČERNÝ FOSFOR PRO CITLIVÉ KLINICKÉ APLIKACE V HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRII BIOMOLEKUL

Název česky

ČERNÝ FOSFOR PRO CITLIVÉ KLINICKÉ APLIKACE V HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRII BIOMOLEKUL

Autoři

MANDAL, Govinda, Lukáš PEČINKA, Lukáš MORÁŇ, Petr VAŇHARA a Josef HAVEL

Vydání

XXIV. Biological Days, Czech-Slovak Biological Society, Brno-Masaryk University Campus, Czech Republic, September 6-7, 2021. 2021

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10406 Analytical chemistry

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta
Změněno: 22. 9. 2021 10:06, Govinda Mandal, Ph.D.

Anotace

V originále

Černý fosfor (BP) představuje nejstabilnější alotropickou modifikaci fosforu s jedinečnými fyzikálně-chemickými vlastnostmi a s vysokým počtem biologických aplikací1. Běžně používané organické matrice mohou trpět řadou nedostatků, jako je například nízká ionizační účinnost a reprodukovatelnost při aplikaci na komplexní biologické vzorky, jako jsou buněčné extrakty. V současné době je velký zájem o nahrazení/modifikaci organických matric použitím anorganických materiálů jako jsou kovové nanočástice a kovové vrstvy. Tyto anorganické materiály poskytují minimální interference v hmotnostních spektrech (nízká fragmentace) a zlepšují ionizaci biomolekul. Černý fosfor selektivně zvyšuje ionizaci některých bio-molekul v MALDI TOF MS, avšak tento jev není zatím dostatečně vysvětlen2,3. V této studii byl BP v kombinaci s běžně používanými matricemi použit pro systematickou MS analýzu vybraných biomolekul (aminokyselin, peptidů a proteinů) a intaktních buněk. Cílem této práce je shrnout, jak BP zlepšuje ionizaci těchto bio-molekul a demonstrovat možnost použití BP pro buněčnou diskriminaci. Účinnost ionizace v matricích obohacených BP byla významně zvýšena a výsledné intenzity analytů v hmotnostních spektrech byly ~4-417krát vyšší než ve spektrech získaných s použitím běžných matric. Bylo také prokázáno, že organická matrice (kyselina sinapová) obohacená BP zlepšuje analýzu MALDI TOF MS intaktních buněk. Analýza hlavních komponent (PCA) ukazuje zlepšení v rozlišení buněk při použití BP obohacené matrice. BP zvyšuje ionizaci široké skupiny biomolekul a tím zlepšuje biologické aplikace MALDI TOF MS.

Česky

Černý fosfor (BP) představuje nejstabilnější alotropickou modifikaci fosforu s jedinečnými fyzikálně-chemickými vlastnostmi a s vysokým počtem biologických aplikací1. Běžně používané organické matrice mohou trpět řadou nedostatků, jako je například nízká ionizační účinnost a reprodukovatelnost při aplikaci na komplexní biologické vzorky, jako jsou buněčné extrakty. V současné době je velký zájem o nahrazení/modifikaci organických matric použitím anorganických materiálů jako jsou kovové nanočástice a kovové vrstvy. Tyto anorganické materiály poskytují minimální interference v hmotnostních spektrech (nízká fragmentace) a zlepšují ionizaci biomolekul. Černý fosfor selektivně zvyšuje ionizaci některých bio-molekul v MALDI TOF MS, avšak tento jev není zatím dostatečně vysvětlen2,3. V této studii byl BP v kombinaci s běžně používanými matricemi použit pro systematickou MS analýzu vybraných biomolekul (aminokyselin, peptidů a proteinů) a intaktních buněk. Cílem této práce je shrnout, jak BP zlepšuje ionizaci těchto bio-molekul a demonstrovat možnost použití BP pro buněčnou diskriminaci. Účinnost ionizace v matricích obohacených BP byla významně zvýšena a výsledné intenzity analytů v hmotnostních spektrech byly ~4-417krát vyšší než ve spektrech získaných s použitím běžných matric. Bylo také prokázáno, že organická matrice (kyselina sinapová) obohacená BP zlepšuje analýzu MALDI TOF MS intaktních buněk. Analýza hlavních komponent (PCA) ukazuje zlepšení v rozlišení buněk při použití BP obohacené matrice. BP zvyšuje ionizaci široké skupiny biomolekul a tím zlepšuje biologické aplikace MALDI TOF MS.

Návaznosti

MUNI/A/1421/2019, interní kód MU
Název: Analytické a fyzikálně-chemické metody ve výzkumu geologických, biologických a syntetických materiálů (Akronym: AFCHMAT)
Investor: Masarykova univerzita, Analytické a fyzikálně-chemické metody ve výzkumu geologických, biologických a syntetických materiálů, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1689/2020, interní kód MU
Název: Zdroje pro tkáňové inženýrství 11 (Akronym: TissueEng 11)
Investor: Masarykova univerzita, Zdroje pro tkáňové inženýrství 11
NV18-08-00299, projekt VaV
Název: Nové nástroje pro kontrolu kvality pluripotentních kmenových buněk a progenitorů určených pro klinické aplikace