PLAČKOVÁ, Klára, Petr BUREŠ a František ZEDEK. Centromere Size Scales With Genome Size Across Eukaryotes. Scientific Reports. London: Nature Research, 2021, roč. 11, č. 1, s. 19811-19817. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-99386-7.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Centromere Size Scales With Genome Size Across Eukaryotes
Autoři PLAČKOVÁ, Klára (203 Česká republika, domácí), Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí) a František ZEDEK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Scientific Reports, London, Nature Research, 2021, 2045-2322.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10602 Biology , Evolutionary biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.996
Kód RIV RIV/00216224:14310/21:00119242
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-99386-7
UT WoS 000706380800025
Klíčová slova anglicky Eukaryotes; centromere size; CenH3; kinetochore size
Štítky CF CELLIM, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635. Změněno: 6. 1. 2024 00:25.
Anotace
Previous studies on grass species suggested that the total centromere size (sum of all centromere sizes in a cell) may be determined by the genome size, possibly because stable scaling is important for proper cell division. However, it is unclear whether this relationship is universal. Here we analyze the total centromere size using the CenH3-immunofluorescence area as a proxy in 130 taxa including plants, animals, fungi, and protists. We verified the reliability of our methodological approach by comparing our measurements with available ChIP-seq-based measurements of the size of CenH3- binding domains. Data based on these two independent methods showed the same positive relationship between the total centromere size and genome size. Our results demonstrate that the genome size is a strong predictor (R-squared= 0.964) of the total centromere size universally across Eukaryotes. We also show that this relationship is independent of phylogenetic relatedness and centromere type (monocentric, metapolycentric, and holocentric), implying a common mechanism maintaining stable total centromere size in Eukaryotes.
Návaznosti
GA20-15989S, projekt VaVNázev: Evoluce velikosti genomu - centromerický drajv v nové roli (Akronym: Centrogenomtah)
Investor: Grantová agentura ČR, Evolution of genome size - a new role for the centromere drive
LM2018129, projekt VaVNázev: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování Czech-BioImaging
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging
VytisknoutZobrazeno: 28. 7. 2024 12:16