Patients With Common Variable Immunodeficiency (CVID) Show Higher Gut Bacterial Diversity and Levels of Low-Abundance Genes Than the Healthy Housemates

BOSÁK, Juraj; Matej LEXA; Kristýna FIEDOROVÁ; Darshak Chandulal GADARA; Lenka MICENKOVÁ; Zdeněk SPÁČIL; Jiří LITZMAN; Tomáš FREIBERGER a David ŠMAJS. Patients With Common Variable Immunodeficiency (CVID) Show Higher Gut Bacterial Diversity and Levels of Low-Abundance Genes Than the Healthy Housemates. Frontiers in Immunology. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2021, roč. 12, May 2021, s. 1-13. ISSN 1664-3224. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2021.671239.

Základní údaje

Originální název

Patients With Common Variable Immunodeficiency (CVID) Show Higher Gut Bacterial Diversity and Levels of Low-Abundance Genes Than the Healthy Housemates

Autoři

BOSÁK, Juraj (703 Slovensko, domácí); Matej LEXA (703 Slovensko, domácí); Kristýna FIEDOROVÁ (203 Česká republika, domácí); Darshak Chandulal GADARA (356 Indie, domácí); Lenka MICENKOVÁ (703 Slovensko, domácí); Zdeněk SPÁČIL (203 Česká republika, domácí); Jiří LITZMAN (203 Česká republika, domácí); Tomáš FREIBERGER (203 Česká republika, domácí) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Frontiers in Immunology, LAUSANNE, FRONTIERS MEDIA SA, 2021, 1664-3224

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30102 Immunology

Stát vydavatele

Švýcarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 8.787

Kód RIV

RIV/00216224:14110/21:00119275

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2021.671239

UT WoS

000655489600001

EID Scopus

2-s2.0-85107039716

Klíčová slova anglicky

common variable immunodeficiency; CVID; microbiome; metagenome; metabolome; Hungatella hathewayi

Štítky

14110114, 14110513, podil, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

Common variable immunodeficiency (CVID) is a clinically and genetically heterogeneous disorder with inadequate antibody responses and low levels of immunoglobulins including IgA that is involved in the maintenance of the intestinal homeostasis. In this study, we analyzed the taxonomical and functional metagenome of the fecal microbiota and stool metabolome in a cohort of six CVID patients without gastroenterological symptomatology and their healthy housemates. The fecal microbiome of CVID patients contained higher numbers of bacterial species and altered abundance of thirty-four species. Hungatella hathewayi was frequent in CVID microbiome and absent in controls. Moreover, the CVID metagenome was enriched for low-abundance genes likely encoding nonessential functions, such as bacterial motility and metabolism of aromatic compounds. Metabolomics revealed dysregulation in several metabolic pathways, mostly associated with decreased levels of adenosine in CVID patients. Identified features have been consistently associated with CVID diagnosis across the patients with various immunological characteristics, length of treatment, and age. Taken together, this initial study revealed expansion of bacterial diversity in the host immunodeficient conditions and suggested several bacterial species and metabolites, which have potential to be diagnostic and/or prognostic CVID markers in the future.

---

Návaznosti

EF16_013/0001761, projekt VaV	Název: RECETOX RI
EF17_043/0009632, projekt VaV	Název: CETOCOEN Excellence
GJ17-24592Y, projekt VaV	Název: Mapování interakcí mezi základními metabolickými pochody a střevní mikroflórou Investor: Grantová agentura ČR, Mapování interakcí mezi základními metabolickými pochody a střevní mikroflórou
MUNI/A/1099/2019, interní kód MU	Název: Faktory nespecifické imunity u některých imunopatologických stavů (Akronym: nespecif. imunita) Investor: Masarykova univerzita, Faktory nespecifické imunity u některých imunopatologických stavů, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1412/2020, interní kód MU	Název: Patogenetický význam nespecifické imunity u některých poruch imunitního systému (Akronym: Nespecifická imunita) Investor: Masarykova univerzita, Patogenetický význam nespecifické imunity u některých poruch imunitního systému
MUNI/M/1322/2015, interní kód MU	Název: Analysis of gastrointestinal microbiome in patients with primary immune deficiencies Investor: Masarykova univerzita, Analysis of gastrointestinal microbiome in patients with primary immune deficiencies, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
ROZV/23/LF13/2019, interní kód MU	Název: Terapeutický potenciál bakteriocinogenních probiotik v léčbě kolibakterióz Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Terapeutický potenciál bakteriocinogenních probiotik v léčbě kolibakterióz, Interní rozvojové projekty
ROZV/28/LF15/2020, interní kód MU	Název: Role bakteriocinů u infekcí močových cest Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Role bakteriocinů u infekcí močových cest, Interní rozvojové projekty
857560, interní kód MU (Kód CEP: EF17_043/0009632)	Název: CETOCOEN Excellence (Akronym: CETOCOEN Excellence) Investor: Evropská unie, CETOCOEN Excellence, Spreading excellence and widening participation
90121, velká výzkumná infrastruktura	Název: RECETOX RI

Přiložené soubory

1798287.pdf