J 2021

Web-based tools for computational enzyme design

MARQUES, Sérgio Manuel; Joan PLANAS IGLESIAS a Jiří DAMBORSKÝ

Základní údaje

Originální název

Web-based tools for computational enzyme design

Vydání

Current Opinion in Structural Biology, London, Elsevier Science Ltd. 2021, 0959-440X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 7.786

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/21:00119876

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

EID Scopus

Klíčová slova anglicky

PROTEIN; STABILITY; DYNAMICS; VIEW

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 15. 2. 2023 23:41, Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D.

Anotace

V originále

Enzymes are in high demand for very diverse biotechnological applications. However, natural biocatalysts often need to be engineered for fine-tuning their properties towards the end applications, such as the activity, selectivity, stability to temperature or co-solvents, and solubility. Computational methods are increasingly used in this task, providing predictions that narrow down the space of possible mutations significantly and can enormously reduce the experimental burden. Many computational tools are available as web-based platforms, making them accessible to non-expert users. These platforms are typically user-friendly, contain walk-throughs, and do not require deep expertise and installations. Here we describe some of the most recent outstanding web-tools for enzyme engineering and formulate future perspectives in this field.

Návaznosti

EF17_043/0009632, projekt VaV
Název: CETOCOEN Excellence
LM2018121, projekt VaV
Název: Výzkumná infrastruktura RECETOX (Akronym: RECETOX RI)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, RECETOX RI
LM2018131, projekt VaV
Název: Česká národní infrastruktura pro biologická data (Akronym: ELIXIR-CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Česká národní infrastruktura pro biologická data
LM2018140, projekt VaV
Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
TN01000013, projekt VaV
Název: Personalizovaná medicína - diagnostika a terapie
Investor: Technologická agentura ČR, Personalizovaná medicína - diagnostika a terapie
814418, interní kód MU
Název: Synthetic biology-guided engineering of Pseudomonas putida for biofluorination (Akronym: SinFonia)
Investor: Evropská unie, Synthetic biology-guided engineering of Pseudomonas putida for biofluorination, Leadership in enabling and industrial technologies (LEIT) (Industrial Leadership)
857560, interní kód MU
(Kód CEP: EF17_043/0009632)
Název: CETOCOEN Excellence (Akronym: CETOCOEN Excellence)
Investor: Evropská unie, CETOCOEN Excellence, Spreading excellence and widening participation

Přiložené soubory