SNOPKOVÁ, Kateřina, Kristýna DUFKOVÁ, Ivo CHAMRÁD, René LENOBEL, Darina ČEJKOVÁ, Marcel KOSINA, Matěj HRALA, Veronika HOLÁ, Ivo SEDLÁČEK a David ŠMAJS. Pyocin-mediated antagonistic interactions in Pseudomonas spp. isolated in James Ross Island, Antarctica. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. HOBOKEN: WILEY, 2022, roč. 24, č. 3, s. 1294-1307. ISSN 1462-2912. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.15809.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Pyocin-mediated antagonistic interactions in Pseudomonas spp. isolated in James Ross Island, Antarctica
Autoři SNOPKOVÁ, Kateřina (203 Česká republika, domácí), Kristýna DUFKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivo CHAMRÁD (203 Česká republika), René LENOBEL (203 Česká republika), Darina ČEJKOVÁ (203 Česká republika), Marcel KOSINA (203 Česká republika, domácí), Matěj HRALA (203 Česká republika, domácí), Veronika HOLÁ (203 Česká republika, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, HOBOKEN, WILEY, 2022, 1462-2912.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10606 Microbiology
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 5.100
Kód RIV RIV/00216224:14110/22:00125088
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.15809
UT WoS 000714374200001
Klíčová slova anglicky James Ross Island; Antarctica; Psychrotrophic Bacteria; P. aeruginosa; Microorganisms; Sequences; Plant; Phage; Pseudomonas; sp. nov.
Štítky 14110113, 14110513, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 3. 2023 15:35.
Anotace
Interactions within bacterial communities are frequently mediated by the production of antimicrobial agents. Despite the increasing interest in research of new antimicrobials, studies describing antagonistic interactions among cold-adapted microorganisms are still rare. Our study assessed the antimicrobial interactions of 36 Antarctic Pseudomonas spp. and described the genetic background of these interactions in selected strains. The overall bacteriocinogeny was greater compared to mesophilic Pseudomonas non-aeruginosa species. R-type tailocins were detected on transmission electron micrographs in 16 strains (44.4%); phylogenetic analysis of the corresponding gene clusters revealed that the P. prosekii CCM 8878 tailocin was related to the Rp3 group, whereas the tailocin in Pseudomonas sp. CCM 8880 to the Rp4 group. Soluble antimicrobials were produced by eight strains (22.-2%); gene mining found pyocin L homologues in the genomes of P. prosekii CCM 8881 and CCM 8879 and pyocin S9-like homologues in P. prosekii CCM 8881 and Pseudomonas sp. CCM 8880. Analysis of secretomes confirmed the production of all S- and L-type pyocin genes. Our results suggest that bacteriocin-based inhibition plays an important role in interactions among Antarctic soil bacteria, and these native, cold-adapted microorganisms could be a promising source of new antimicrobials.
Návaznosti
LM2015078, projekt VaVNázev: Česká polární výzkumná infrastruktura (Akronym: CzechPolar2)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Polar Research Infrastructure
LM2015091, projekt VaVNázev: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky
MUNI/A/1325/2020, interní kód MUNázev: Biomedicínské vědy
Investor: Masarykova univerzita, Biomedicínské vědy
MUNI/A/1486/2020, interní kód MUNázev: Nové možnosti detekce a terapie nozokomiálních patogenů (Akronym: NMDTNP)
Investor: Masarykova univerzita, Nové možnosti detekce a terapie nozokomiálních patogenů
VytisknoutZobrazeno: 27. 4. 2024 05:32