MALIŠOVÁ, Lucia, Petra ŠPANĚLOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Petr PAJER, Martin MUSÍLEK, Blanka PUCHÁLKOVÁ, Vladislav JAKUBŮ, Helena ŽEMLIČKOVÁ a Renáta ŠAFRÁNKOVÁ. The first case of Planococcus glaciei found in blood, a report from the Czech Republic. Folia microbiologica. Praha: Institute of Microbiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, 2022, roč. 67, č. 1, s. 121-127. ISSN 0015-5632. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12223-021-00919-4.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název The first case of Planococcus glaciei found in blood, a report from the Czech Republic
Autoři MALIŠOVÁ, Lucia, Petra ŠPANĚLOVÁ (garant), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Petr PAJER, Martin MUSÍLEK, Blanka PUCHÁLKOVÁ, Vladislav JAKUBŮ, Helena ŽEMLIČKOVÁ a Renáta ŠAFRÁNKOVÁ.
Vydání Folia microbiologica, Praha, Institute of Microbiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, 2022, 0015-5632.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10606 Microbiology
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.600
Kód RIV RIV/00216224:14310/22:00125131
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1007/s12223-021-00919-4
UT WoS 000701383100001
Klíčová slova anglicky Planococcus glaciei; identification; human clinical material; hemoculture
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 1. 2022 14:09.
Anotace
The isolation of Planococcus glaciei (designed strain CNCTC 7660) from blood of a patient with appendicitis is reported. Species P. glaciei (type strain CGMCC 1.6846( T)) was for the first time identified as an environmental bacterium acquired from a glacier in China in 2009. To reveal the identity of the isolate CNCTC 7660, the 16S rDNA sequencing and the whole genome sequencing (Illumina MiSeq, Oxford Nanopore) were performed. The level of 16S rDNA gene sequencing similarity between CNCTC 7660 and CGMCC 1.6846( T) was 99.55%. Phylogenetic analysis and average nucleotide analysis (ANI) based on the whole genome sequencing confirmed that the isolate CNCTC 7660 and CGMCC1.6846( T) had ANI value above the taxonomic threshold for belonging to the same species (95%). The G + C content of CNCTC 7660 DNA was 46.8% (mol/mol). Except for the growth temperature, strains CGMCC1.6846( T) and CNCTC 7660 were distinguished also biochemically. Due to the lack of information about the pathogenicity of P. glaciei, the possibility that it exerts pathogenicity in persons is suggested. But for understanding the nature of this species, further cases are needed.
Návaznosti
LM2018140, projekt VaVNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
VytisknoutZobrazeno: 7. 9. 2024 14:03