KOVAŘOVIC, Vojtěch, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Stanislava KRÁLOVÁ, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Pavel ŠVEC, Meina NEUMANN-SCHAAL, Tibor BOTKA, Tereza GELBÍČOVÁ, Eva STAŇKOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus ratti sp. nov. isolated from a lab rat. Pathogens. Basel, Switzerland: MDPI, 2022, roč. 11, č. 1, s. 1-16. ISSN 2076-0817. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/pathogens11010051.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Staphylococcus ratti sp. nov. isolated from a lab rat
Autoři KOVAŘOVIC, Vojtěch (203 Česká republika, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Petr PETRÁŠ (203 Česká republika), Stanislava KRÁLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Ivana MAŠLAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Pavel ŠVEC (203 Česká republika, domácí), Meina NEUMANN-SCHAAL (276 Německo), Tibor BOTKA (203 Česká republika, domácí), Tereza GELBÍČOVÁ (203 Česká republika, domácí), Eva STAŇKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jiří DOŠKAŘ (203 Česká republika, domácí) a Roman PANTŮČEK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Pathogens, Basel, Switzerland, MDPI, 2022, 2076-0817.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30303 Infectious Diseases
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.700
Kód RIV RIV/00216224:14310/22:00125132
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.3390/pathogens11010051
UT WoS 000758527500001
Klíčová slova anglicky laboratory rat; Staphylococcus; Hyicus-Intermedius species group; taxonomy; whole genome sequencing; variable genetic element; genomic island
Štítky 14110525, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 3. 2022 15:21.
Anotace
Staphylococci from the Staphylococcus intermedius-Staphylococcus hyicus species group include numerous animal pathogens and are an important reservoir of virulence and antimicrobial resistance determinants. Due to their pathogenic potential, they are possible causative agents of zoonoses in humans; therefore, it is important to address the properties of these strains. Here we used a polyphasic taxonomic approach to characterize the coagulase-negative staphylococcal strain NRL/St 03/464T, isolated from the nostrils of a healthy laboratory rat during a microbiological screening of laboratory animals. The 16S rRNA sequence, MALDI-TOF mass spectrometry and positive urea hydrolysis and beta-glucuronidase tests clearly distinguished it from closely related Staphylococcus spp. All analyses have consistently shown that the closest relative is Staphylococcus chromogenes; however, values of digital DNA-DNA hybridization <35.3% and an average nucleotide identity <81.4% confirmed that the analyzed strain is a distinct Staphylococcus species. Whole-genome sequencing and expert annotation of the genome revealed the presence of novel variable genetic elements, including two plasmids named pSR9025A and pSR9025B, prophages, genomic islands and a composite transposon that may confer selective advantages to other bacteria and enhance their survival. Based on phenotypic, phylogenetic and genomic data obtained in this study, the strain NRL/St 03/464T (= CCM 9025T = LMG 31873T = DSM 111348T) represents a novel species with the suggested name Staphylococcus ratti sp. nov.
Návaznosti
LM2018140, projekt VaVNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
MUNI/A/1522/2020, interní kód MUNázev: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 9 (Akronym: MBG9)
Investor: Masarykova univerzita, Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 9
NU21J-05-00035, projekt VaVNázev: Synergie lytických bakteriofágů a antibiotik v léčbě povrchových infekcí způsobených Staphylococcus aureus (Akronym: PAS-based therapy of S. aureus infections)
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Synergy of lytic bacteriophages and antibiotics in the therapy of topical infections of Staphylococcus aureus, Podprogram 2 - juniorský - výzkumníci do 35 let
VytisknoutZobrazeno: 20. 9. 2024 21:00