2021
Ascertainment rate estimate from hospital data used in modelling COVID-19 epidemics
ECLEROVÁ, Veronika a Lenka PŘIBYLOVÁZákladní údaje
Originální název
Ascertainment rate estimate from hospital data used in modelling COVID-19 epidemics
Název česky
Odhad míry dat z nemocničních dat použitý pro modelování epidemie COVID-19
Autoři
ECLEROVÁ, Veronika (203 Česká republika, domácí) a Lenka PŘIBYLOVÁ (203 Česká republika, domácí)
Vydání
Epidemics8 - 8th International Conference on Infectious Disease Dynamics, 2021
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Prezentace na konferencích
Obor
10102 Applied mathematics
Stát vydavatele
Velká Británie a Severní Irsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/21:00123732
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
ascertainment rate; epidemic monitoring; COVID-19; SARS-CoV-2
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 14. 1. 2022 10:26, RNDr. Veronika Eclerová, Ph.D.
Anotace
V originále
We based our approach on a mechanistic compartmental SEIR model with additional undetected cohort A (stands for absent infected). To estimate the size of compartment A, we use a novel concept, a moving ascertainment rate estimate computed from data of hospitalized subjects. We estimate the probability of detection from the proportion of cases not detected before hospital admission using a conditional probability. We have developed an extended ZSEIAR model that also includes unknown dynamics in the affected clusters. We optimize the size of affected clusters in the model since the effects as seasonality or government measures cannot be easily distinguished. We submit our predictions to European Covid-19 Forecast Hub https://covid19forecasthub.eu/ and the web Czech Monitoring, Analysis and Management of Epidemic Situations https://webstudio.shinyapps.io/MAMES/.
Návaznosti
| MUNI/A/1615/2020, interní kód MU |
| ||
| MUNI/11/02202001/2020, interní kód MU |
|