NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ, Norbert GAŠPARIK a Jozef HRITZ. 19F Trp labelling as a selective probe into the dimeric interface. In Instruct Biennial Structural Biology Conference 2022. 2022.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název 19F Trp labelling as a selective probe into the dimeric interface
Autoři NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ, Norbert GAŠPARIK a Jozef HRITZ.
Vydání Instruct Biennial Structural Biology Conference 2022, 2022.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky 14-3-3 protein; 19F NMR; 19F Trp značení
Klíčová slova anglicky 14-3-3 protein; 19F NMR; 19F Trp labelling
Příznaky Mezinárodní význam
Změnil Změnila: Mgr. Alexandra Náplavová, učo 484296. Změněno: 24. 5. 2022 14:37.
Anotace
The self-association of proteins is a fundamental mechanism in cell. The oligomerization offers a way of protein regulation, often broadening their functionality [1]. One of the rarest amino acids tryptophan (Trp) has a unique role in protein self-association [2]. It has been previously described that Trp is commonly present in so called dimerization hot spots partaking in dimer formation [3,4]. A method that could selectively focus on Trp could therefore offer a unique probe into protein dimerization. Nuclear magnetic resonance is a powerful tool in structural biology. Traditional double 13C, 15N labelling can be complemented by the 19F labelling which is a simple and straight-forward method [5]. The biggest advantage of 19F labelling is high signal intensity and a selective labelling of only chosen amino acid (usually Trp, Tyr or Phe), leading to less convoluted spectra without background noise. For these reasons, the 19F labelling may present a technique especially useful for determination of parameters connected to protein dimerization. In this work, we explore application of 19F Trp labelling on example of 14-3-3 proteins. The eukaryotic 14-3-3 proteins are important regulators involved in number of processes. Their dimeric form is crucial for proper function and the mechanism of dimer-ligand interaction has been thoroughly described [6]. Upon study of post-translational modifications, it has been discovered that phosphorylation of 14-3-3 at Ser58 located at dimeric interface leads to monomerization [7]. Intriguingly, residue neighbouring Ser58 is Trp59. We are thus comparing 19F Trp labelled dimeric 14-3-3 wild type and monomeric 14-3-3 phosphorylated at Ser58 and showing the possibilities that such labelling offers for study of dimerization.
Návaznosti
LTAUSA18168, projekt VaVNázev: Selektivní NMR značení jako nástroj pro charakterizaci proteinových komplexů zapojených do neurodegenerativních onemocnění
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Selektivní NMR značení jako nástroj pro charakterizaci proteinových komplexů zapojených do neurodegenerativních onemocnění, INTER-ACTION
MUNI/C/0091/2022, interní kód MUNázev: Structural and interaction properties of 14-3-3 proteins in the monomeric state.
Investor: Masarykova univerzita, Structural and interaction properties of 14-3-3 proteins in the monomeric state., Podpora vynikajících diplomových prací
VytisknoutZobrazeno: 12. 7. 2024 13:37