Caver Web 1.2

MUSIL, Miloš, Andrej JEŽÍK, Marie HAMŠÍKOVÁ, Jan ŠTOURAČ, Jakub GALGONEK, jiří VONDÁŠEK, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Caver Web 1.2. 2022.

Základní údaje

• Originální název: Caver Web 1.2
• Název anglicky: Caver Web 1.2
• Autoři: MUSIL, Miloš (203 Česká republika, domácí), Andrej JEŽÍK, Marie HAMŠÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jan ŠTOURAČ (203 Česká republika, domácí), Jakub GALGONEK, jiří VONDÁŠEK, David BEDNÁŘ (203 Česká republika, domácí) a Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: 2022.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Software
• Obor: 10608 Biochemistry and molecular biology
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: obsah podléhá obchodnímu tajemství
• WWW: Caver Web 1.2 je nová verze webového serveru, která spojuje možnost stanovení proteinových tunelů s výpočtem trajektorie ligandů. Nová verze serveru CaverWeb byla rozšířena o možnost využít nové ligandy z Integrované databáze malých molekul (IDSM) a o zc
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/22:00127433
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova anglicky: Web serverů; proteins; ligand transport; tunnels and channels in proteins; virtuální skríning
• Technické parametry: V budoucnu je plánována nabídka potencionálním partnerům.

Anotace

*Caver Web 1.2 je nová verze webového serveru, která spojuje možnost stanovení proteinových tunelů s výpočtem trajektorie ligandů. Nová verze serveru CaverWeb byla rozšířena o možnost využít nové ligandy z Integrované databáze malých molekul (IDSM) a o zcela zautomatizovaný virtuální skríning umožňující rychlé vyhodnocení předdefinovaného setu více jak 4300 léčiv schválených FDA.

Anotace anglicky

*CaverWeb 1.2 is a new version of the web server combining the capabilities for the detection of protein tunnels with the calculation of the ligand trajectories. The new version of the CaverWeb server was expanded with the ability to fetch novel ligands from the Integrated Database of Small Molecules (IDSM) and with the fully automated virtual screening pipeline allowing for the fast evaluation of the predefined set of over 4,300 FDA-approved drugs.

Návaznosti

• LX22NPO5102, projekt VaV: Název: Národní ústav pro výzkum rakoviny (Akronym: NÚVR)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní ústav pro výzkum rakoviny, 5.1 EXCELES