R 2022

PredictSNP Onco 1.0

ŠTOURAČ, Jan, Rayyan Tariq KHAN, Simeon BORKO, Petra POKORNÁ, Adam DOBIÁŠ et. al.

Základní údaje

Originální název

PredictSNP Onco 1.0

Název anglicky

PredictSNP Onco 1.0

Autoři

ŠTOURAČ, Jan (203 Česká republika, garant, domácí), Rayyan Tariq KHAN (586 Pákistán, domácí), Simeon BORKO (703 Slovensko, domácí), Petra POKORNÁ (203 Česká republika), Adam DOBIÁŠ (203 Česká republika, domácí), José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO (620 Portugalsko, domácí), Jaroslav ŠTĚRBA (203 Česká republika, domácí), Ondřej SLABÝ (203 Česká republika, domácí), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, domácí) a David BEDNÁŘ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

2022

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Software

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

obsah podléhá obchodnímu tajemství

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14310/22:00127438

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

Web server; cancer; medicine; mutation; protein; prediction

Technické parametry

Doposud je využiváno interně k výzkumným účelům.
Změněno: 5. 4. 2023 11:45, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

Anotace

V originále

*PredictSNP Onco 1.0 je jedinečný web server pro analýzu vlivu mutací na proteiny, které jsou často měněny v různých typech rakoviny. Server je navržen tak, aby vyhodnotil dopad mutací na sekvenční a strukturní vlastnosti proteinu a použil virtuální skríning k identifikaci potenciálních inhibitorů s využitím strategie znovupoužití léčiv pro možnou léčbu. PredictSNP Onco využívá k predikci nejmodernější výpočetní nástroje ve spojení s informacemi získanými ze zavedených a spolehlivých databází. Server je volně dostupný pro lékařskou komunitu na https://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp-onco.

Anglicky

*PredictSNP Onco 1.0 is a unique web server for the analysis of the effects of mutations on proteins that are frequently altered in various cancer types. The server is designed to assess the impact of mutations on the sequential and structural properties of a protein and apply a virtual screening method to identify potential inhibitors using the drug repurposing strategy for possible treatment. PredictSNP Onco relies on predictions of state-of-the-art computational tools combined with information obtained from established and reliable databases. The server is freely available for the medical community at https://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp-onco.

Návaznosti

LX22NPO5102, projekt VaV
Název: Národní ústav pro výzkum rakoviny (Akronym: NÚVR)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní ústav pro výzkum rakoviny, 5.1 EXCELES